Drei wissenschaftliche Studien liefern technische Informationen zur Ermittlung von Gebieten, die in das nationale System von Schutzgebieten aufgenommen werden sollten. Eine Bewertung der marinen Ökoregionen in Mesoamerika war der erste Schritt, um eine Agenda für die Erhaltung der Meeres- und Küstenbiodiversität auf regionaler Ebene zu erstellen. Um die für die ökoregionale Ebene festgelegten Ziele zu erreichen, wurden Lücken in der Repräsentativität und Integrität der marinen und küstennahen biologischen Vielfalt in Costa Rica durch einen Vergleich des nationalen Systems der Meeresschutzgebiete mit den bei der Evaluierung ermittelten wichtigen Schutzgebieten ermittelt. Die nationalen Schutzgebiete wurden in der Lückenanalyse als vorrangig eingestuft. Zusätzliche technische Bewertungen wurden durchgeführt, um den Erhaltungszustand auf lokaler Ebene zu untersuchen. Diese wissenschaftlichen Informationen trugen dazu bei, Überlegungen zu den Prioritäten auf lokaler Ebene sowie zu den tatsächlichen und potenziellen Nutzungen und den Nutzungskonflikten anzustellen.

Eine Kooperationsvereinbarung legt die Aufgaben und Zuständigkeiten der einzelnen Partner in der öffentlich-privaten Partnerschaft fest und garantiert die Durchsetzung eines zeitlich festgelegten Umsetzungs- und Überwachungsplans zur Erreichung der Erhaltungsziele.

Neben der Festlegung von Erhaltungszielen werden im Umsetzungs- und Überwachungsplan auch strategische Ziele und Aktivitäten aufgeführt, die innerhalb eines bestimmten Zeitraums umgesetzt werden sollen, um diese Ziele zu erreichen. Darüber hinaus zeigt der Plan potenzielle Risiken und Schwierigkeiten auf und liefert Indikatoren für die Überwachung und Bewertung.

FMCN und CONANP arbeiten in einer öffentlich-privaten Partnerschaft, der Gulf of California Marine Endowment (GCME), zusammen. Dies ist in einer Kooperationsvereinbarung formalisiert, in der die Rolle und die Verantwortlichkeiten der Partner festgelegt sind. Das FMCN ist für die Verwaltung der finanziellen Mittel verantwortlich und das CONANP stellt sicher, dass diese Mittel für strategische Erhaltungsmaßnahmen eingesetzt werden.

Da die mexikanischen Vorschriften es dem CONANP verbieten, private Spenden direkt entgegenzunehmen, leitet das FMCN die Mittel für die Verwaltung der einzelnen Schutzgebiete über lokale Organisationen weiter und begleitet sie mit strengen Finanzkontrollen und erfahrenen und gut ausgebildeten Mitarbeitern. Dieser Mechanismus der öffentlich-privaten Zusammenarbeit stellt sicher, dass die Mittel transparent eingesetzt werden und trägt dazu bei, die Beteiligung der Zivilgesellschaft am MPA-Management zu stärken.

Aus jedem der sechs PECC-Ausschüsse wurden zwei Mitglieder ausgewählt und nach Dar Es Salaam gebracht, um mehrere Naturschutzorganisationen sowie die Wildlife Division als die Regierungsinstitution zu besuchen, die sich direkt mit der Verwaltung von Schutzgebieten (außer Nationalparks) befasst. Diese Reise verschaffte den Ausschussmitgliedern einen Überblick darüber, wie Schutzgebiete verwaltet werden, und verschaffte ihnen ein Verständnis für die Vorschriften. Sie konnten mit wichtigen Personen über ihre Bedenken bezüglich des Saadani-Nationalparks diskutieren und erhielten Reaktionen darauf, wie diese Bedenken in der nationalen Schutzgebietspolitik berücksichtigt werden. Sie erfuhren auch, welche Gemeinsamkeiten es mit anderen Parks gibt, in denen die angrenzenden Gemeinden mit ähnlichen Problemen zu kämpfen haben, und diskutierten einige Lösungen, die andernorts zur Bewältigung solcher Probleme gefunden wurden. Der Besuch half den Ausschussmitgliedern zu erkennen, dass viele Vorschriften auf einer höheren Ebene als der der einzelnen Parks beschlossen werden. Dadurch änderte sich ihre Ansicht über die Handlungsfähigkeit der Mitarbeiter des Saadani-Parks.