Por sua natureza, as pescarias de pequena escala geralmente têm dados limitados, pouco sistematizados e de curta duração. Essa escassez de informações representa um desafio para entender, por exemplo, a interação que o equipamento de pesca tem com o ecossistema e seu impacto no habitat; essas informações são fundamentais para a implementação de um projeto de melhoria da pesca. Em todo o mundo, foram desenvolvidas diferentes metodologias para gerar informações sobre os impactos da pesca no ecossistema; uma delas é a modelagem baseada no programa Ecopath com o Ecosim.
A COBI utilizou essa ferramenta incluindo informações geradas por pescadores e pescadoras por meio de registros de pesca, bem como informações biológicas e ecológicas sobre as espécies que habitam as zonas de pesca. Além disso, para fortalecer o modelo, o conhecimento ecológico tradicional das comunidades pesqueiras foi integrado por meio da aplicação de entrevistas, das quais foram obtidas informações relevantes sobre a dieta das espécies, sua distribuição geográfica, época de reprodução e avistamentos.