La biorestauration consiste à utiliser des organismes pour éliminer les polluants du sol ou de l'eau. Dans le système de bioremédiation, l'eau du canal de Chonta passe d'abord par des bassins de décantation, puis par des bassins plus grands où des quenouilles et des roseaux - des plantes locales - ont été installés pour absorber la rouille de l'eau par leurs racines. Des bactéries sont également utilisées pour réduire l'acidité de l'eau. Enfin, le canal fournit 120 litres d'eau purifiée par seconde à l'ensemble de la population et a été mis en place grâce à la collaboration d'institutions basées sur la demande de la communauté. Il a été conçu selon des critères de connaissances traditionnelles et scientifiques : les endroits appropriés pour construire les bassins de sédimentation, la zone humide, la sélection de plantes telles que la quenouille et la technologie de transplantation dans les zones humides. Les membres du CIAL et la communauté nettoient les bassins de sédimentation une fois par an, entre avril et mai. Au début des pluies, ils laissent passer un débit minimum, uniquement pour l'entretien des zones humides et l'utilisation de certains agriculteurs.

Le CIAL contrôle la qualité de l'eau du système deux fois par an, en mesurant principalement le pH et la conductivité électrique.