Les agriculteurs gèrent leur environnement de manière à atténuer les perturbations, telles que les inondations, les sécheresses et les maladies.
Les forêts et les arbres des zones humides sont protégés afin de réguler les niveaux d'eau. Des pratiques sont mises en œuvre, telles que le hersage au début du printemps ou l'utilisation de plantes nourricières ou d'arbres pour l'ombre, afin de préserver l'humidité du sol.
Les parasites et les mauvaises herbes sont contrôlés par la culture intercalaire et la rotation des cultures dans les champs, par le pâturage alterné par différentes espèces, par l'enlèvement manuel et par la protection ou la création d'habitats pour les espèces qui contrôlent les parasites, par exemple les oiseaux et les insectes.
Les arbres, les buissons et les plantes à fleurs sauvages, particulièrement importants pour les pollinisateurs, sont protégés.
Le fait de se trouver dans un environnement où l'habitat naturel coexiste avec l'agroécosystème et est protégé permet aux écosystèmes de fonctionner et de fournir des services à l'agriculture.
La protection et l'amélioration des services fournis par les écosystèmes naturels sont essentielles à la réussite de l'agriculture dans un climat variable et changeant.