
Laboratoire de santé, de génétique et de médecine légale pour la faune sauvage du département de la faune sauvage de Sabah - Conception et développement

Le projet PREDICT, un programme mondial de surveillance des agents pathogènes, a débuté dans l'État de Sabah en 2012 dans le cadre d'une collaboration entre le Sabah Wildlife Department (SWD), Conservation Medicine (CM) et EcoHealth Alliance (EHA). Le Sabah Wildlife Department's - Wildlife Health, Genetic and Forensic Laboratory (WHGFL) est un laboratoire de niveau de biosécurité 2 qui a été construit à Sabah pour éviter d'envoyer des milliers d'échantillons collectés dans le cadre de PREDICT et de projets en cours hors de l'État pour des tests de dépistage de pathogènes. CM a conçu et supervisé la construction de ce laboratoire certifié depuis 2013 selon les normes internationales et fait partie du comité de gestion. Le laboratoire est utilisé pour le dépistage des maladies zoonotiques, ainsi que pour la recherche génétique et médico-légale. 65 nouveaux virus et 18 virus connus ont été détectés à Sabah grâce au projet PREDICT, fournissant au gouvernement malaisien des données exploitables pour informer les politiques d'atténuation des risques au niveau national et au niveau de l'État.
Contexte
Défis à relever
L'envoi d'échantillons en Malaisie péninsulaire ou à l'étranger pour le dépistage des virus crée un risque pour la biosécurité et la sûreté biologique, ne contribue pas au développement des capacités locales et demande trop de temps, d'énergie et d'argent pour être durable. Pour combler cette lacune dans les capacités à Sabah, un bâtiment vide existant a été identifié et rénové pour créer un laboratoire de niveau de biosécurité 2 certifiable selon les normes internationales. Ainsi, les échantillons d'animaux sauvages collectés dans le cadre du projet PREDICT et des projets ultérieurs ont pu être analysés rapidement et en toute sécurité pour détecter la présence de virus zoonotiques. La création du laboratoire a également permis à la SWD de lutter plus efficacement contre le braconnage et la contrebande d'espèces sauvages. Auparavant, les échantillons étaient envoyés en Malaisie péninsulaire et les résultats étaient souvent retardés, ce qui entraînait la libération et la disparition des suspects. Grâce au WHGFL, la SWD et la DGFC peuvent traiter les échantillons médico-légaux dès qu'ils sont reçus, ce qui entraînera une augmentation des poursuites. Cette capacité sera encore renforcée lorsque le WHGFL obtiendra l'accréditation ISO 17025.
Emplacement
Traiter
Résumé du processus
La solution démontre comment les partenariats et la collaboration peuvent faciliter l'utilisation efficace et efficiente des ressources existantes, comme le montre le bloc de construction "Utilisation de l'infrastructure existante". Le développement et l'expansion continue des capacités du WHGFL renforcent l'importance et l'utilité de l'accès local et de l'appropriation locale de la technologie pour servir les priorités locales et mondiales.
Blocs de construction
Utilisation de l'infrastructure existante
Lorsque le projet PREDICT a commencé à travailler à Sabah, il n'y avait pas de laboratoire dédié à l'analyse d'échantillons de faune sauvage qui répondait aux normes nécessaires en matière de biosécurité. Les obstacles financiers et logistiques liés à la construction de l'infrastructure nécessaire étaient trop importants pour ce projet, et la construction d'un nouveau laboratoire n'était pas envisageable. Au lieu de cela, SWD et CM ont identifié un bâtiment vide appartenant à SWD à Sabah et l'ont rénové pour qu'il réponde aux normes internationales de laboratoire, telles que détaillées dans le guide Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories Guidelines (6th Ed.) pour les exigences de niveau 2 de confinement de la biosécurité, afin d'établir le WHGFL. Ces améliorations ont permis au projet de gagner du temps et de l'argent, de conserver les échantillons en toute sécurité au Sabah pour le dépistage des virus et de créer un laboratoire ultramoderne permettant au SWD et à la DGFC de poursuivre leurs recherches génétiques et médico-légales.
Facteurs favorables
Si l'existence d'une infrastructure physique sur laquelle on peut s'appuyer est le facteur le plus important, le soutien du gouvernement de l'État de Sabah, du Sabah Wildlife Department et du Dr Stuart D. Blacksell du MORU a permis d'effectuer les changements nécessaires.
Leçon apprise
Bien qu'un biosafe et un laboratoire bio-sécurisé soient essentiels pour toute région souhaitant effectuer des dépistages de maladies, la plupart des sites ne disposent pas de l'espace, de la capacité ou des ressources nécessaires pour construire l'infrastructure requise à partir de zéro. Face à ce défi logistique et financier, l'équipe du projet a trouvé des solutions innovantes en utilisant les ressources actuellement disponibles dans le pays et des solutions durables peu coûteuses pour créer cette installation de pointe. Lors de la conception d'un laboratoire, il est important de déterminer exactement quels sont les échantillons, les activités et les processus qui y seront menés, de procéder à une évaluation complète des risques et des lacunes et de concevoir une installation permettant de gérer ces risques et ces dangers en fonction de vos besoins spécifiques.
Partenariats et collaboration
Depuis la conception du projet PREDICT jusqu'à la gestion quotidienne du laboratoire, l'efficacité de la collaboration intersectorielle entre les partenaires a été un élément essentiel. Le projet PREDICT a réuni des organisations à but non lucratif de conservation et de santé, ainsi que des administrations locales et fédérales malaisiennes, afin qu'elles collaborent à la surveillance des zoonoses. Au cours des dix dernières années, le WHGFL a été en mesure d'étendre ses activités à de nouvelles recherches en matière de surveillance, de génétique et de médecine légale, grâce au renforcement de ses capacités dans le cadre d'une collaboration ouverte et productive. Le département de la faune et de la flore de Sabah a renforcé son engagement en augmentant chaque année son financement pour le WHGFL et en dirigeant le comité de gestion. Le comité de gestion veille à ce que les multiples projets utilisant le petit laboratoire soient coordonnés et organisés, en particulier lorsque de nouveaux projets sont lancés et que le champ d'action s'élargit.
Facteurs favorables
L'approche "Une seule santé" a été utilisée à chaque étape, en veillant à ce que les priorités des différents secteurs soient entendues et respectées. Des secteurs cloisonnés ont été réunis pour atteindre un objectif commun de conservation grâce à des dépistages de maladies zoonotiques qui ont favorisé la santé des humains et des animaux sauvages. En soulignant l'interconnexion de la santé humaine, animale et environnementale, la collaboration, plutôt que la concurrence, a été mise en avant et encouragée. Les résultats du dépistage des maladies de la faune sauvage ont fourni au département de la santé de l'État de Sabah des données exploitables pour informer les politiques d'atténuation des risques au niveau de l'État.
Leçon apprise
De multiples partenaires ont participé à la rénovation d'un bâtiment vide pour créer un laboratoire répondant aux normes internationales de biosécurité et de sûreté biologique, et si l'investissement initial provenait de sources extérieures, ces dernières années, les dirigeants locaux ont joué un rôle plus important dans la gestion. La réussite du projet PREDICT a démontré l'importance du laboratoire pour les efforts de recherche locaux et mondiaux, ce qui a incité les dirigeants locaux à investir davantage, tant sur le plan financier que sur celui de la largeur de bande. Cela a permis aux partenariats naissants de se développer et de s'approfondir au fil du temps.
Impacts
Premier laboratoire de confinement biologique certifié BSL-2 en Asie du Sud-Est et répondant aux normes internationales spécifiquement pour le travail sur la faune sauvage, le WHGFL est un excellent exemple de la manière dont, avec des dépenses de construction limitées et un budget d'entretien annuel durable, une installation de biosécurité et de sûreté biologique de pointe peut être mise en place et entretenue pour le travail sur la faune sauvage. Le WHGFL permet au SWD d'évaluer rapidement la santé des animaux sauvages avant leur déplacement, de s'engager dans des efforts complets de dépistage des maladies avec des partenaires tels que CM et EHA et de mener d'importants dépistages et recherches génétiques et médico-légales. CM a coordonné des contrôles de santé et des dépistages de maladies avec SWD, le Sepilok Orangutan Rehabilitation Centre (SORC) et le Bornean Sun Bear Conservation Centre (BSBCC) pour les orangs-outans, les gibbons, les ours solaires et les éléphants de Bornéo détenus en captivité et dans la nature qui sont en danger. À ce jour, six nouveaux virus et six virus connus provenant de trois espèces locales menacées ont été identifiés. Ces résultats sont essentiels pour permettre au SWD de prendre des décisions sur les mesures à prendre pour gérer et conserver ces animaux importants. CM travaille en étroite collaboration avec le SWD et le Danau Girang Field Centre (DGFC) pour obtenir l'accréditation ISO 17025 pour le laboratoire. L'obtention de cette accréditation permettra au SWD de commencer à utiliser le laboratoire pour traiter des échantillons médico-légaux dans le cadre de poursuites judiciaires afin de l'aider dans ses efforts de lutte contre le commerce illégal d'espèces sauvages et le braconnage.
Bénéficiaires
Département de la faune et de la flore de Sabah
Département de la santé de l'État de Sabah
Chercheurs locaux
Personnel de laboratoire
Faune et flore
Humains
Objectifs de développement durable
Histoire

CM et EHA travaillent en Malaisie depuis plus de 15 ans. Nous encourageons le gouvernement et les parties prenantes de l'industrie à tenir compte de One Health lorsqu'ils envisagent le développement durable et la formation des scientifiques locaux à l'échantillonnage de la faune et aux techniques de laboratoire de pointe. Sur l'île de Bornéo, nous avons forgé des partenariats inestimables avec d'autres organisations qui travaillent sans relâche pour préserver la biodiversité unique de la région.
L'une d'entre elles est SWD qui, en 1964, a créé SORC près de Sandakan, Sabah, dans le but de sauver et de réhabiliter les orangs-outans de Bornéo(Pongo pygmaeus morio), gravement menacés d'extinction et déplacés par le développement humain. Depuis son ouverture, le SORC a sauvé et réhabilité des centaines d'orangs-outans autour de Sabah, la plupart blessés ou orphelins.
Mais tous les orangs-outans sauvés n'ont pas cette chance. Trois d'entre eux - Tiger, Rosalinda et Yoda - ont été diagnostiqués porteurs de l'hépatite B à leur arrivée au SORC. À l'époque, le seul test dont disposait le Sabah Wildlife Department était un test sérologique qui ne permettait pas de déterminer la souche d'hépatite B dont les animaux étaient atteints. Une souche de l'hépatite B pouvant être mortelle pour l'homme, le SORC n'a pas eu d'autre choix que de mettre les trois animaux en quarantaine pour éviter la transmission de la maladie aux autres orangs-outans et aux visiteurs humains du SORC.
Lors d'un dépistage annuel des orangs-outans du SORC, l'équipe du CM et de l'unité de santé de la faune sauvage du SWD, avec le soutien de l'EHA, a prélevé des échantillons sur les trois animaux mis en quarantaine et les a testés à l'aide des protocoles PCR publiés sur l'hépatite au WHGFL. L'analyse de séquençage a montré que les trois orangs-outans étaient atteints de l'hépatite B de l'orang-outan, qui est endémique chez les orangs-outans sauvages et ne pose aucun problème de santé publique. Une fois cette question résolue, Tiger, Rosalinda et Yoda ont pu être relâchés dans leur nouvel enclos de réhabilitation : ils sont sortis de la quarantaine et peuvent jouer sur le sol et profiter du soleil pour la première fois depuis qu'ils ont été sauvés. Cette histoire se termine bien pour Rosalinda en 2016 et Tiger en 2017, qui ont ensuite été relâchés dans la nature au cœur de la Tabin Wildlife Reserve à Lahad Datu, une jungle secondaire mature et une forêt primaire vierge couvrant près de 300 000 acres.