La conformité intégrée est une approche clé qui contribue à la gestion efficace de la RGO. Un certain nombre de stratégies de conformité sont utilisées pour parvenir à une gestion de la conformité, comprenant un éventail beaucoup plus large de stratégies que la simple surveillance ou l'application (voir le tableau 1 ci-dessous). Aujourd'hui, l'approche de conformité de la GBR est reconnue comme étant d'un niveau mondial. Elle est mise en œuvre par une unité conjointe de gestion de la conformité sur le terrain (FMCU) composée d'agents formés et compétents des gouvernements de l'Australie et du Queensland, qui travaillent en étroite collaboration. La FMCU joue un rôle central dans la coordination du déploiement de toutes les ressources disponibles en matière de conformité dans la GBR. Les activités sur le terrain sont menées par un certain nombre d'agences partenaires clés, notamment le Queensland Parks and Wildlife Service, le Queensland Boating and Fisheries Patrol, le Queensland Police Service et le Australia's Border Protection Command (BPC). La planification des patrouilles est basée sur des informations issues du renseignement et permet une détection maximale ainsi qu'un effet dissuasif. Le BPC est le principal fournisseur d'opérations aériennes et assure une surveillance aérienne ciblée. Les équipages du BPC sont formés par la FMCU à la détection des infractions commises dans les parcs marins et à la collecte des preuves qui s'ensuit.