Pemindahan tanaman invasif lintas batas secara bersama-sama
Tanaman invasif muncul di kedua sisi Sungai Thaya, yang merupakan batas internasional dan perbatasan antara kedua taman nasional. Tanaman disingkirkan dari kedua sisi sungai oleh staf dari masing-masing taman nasional, dan pemindahan tanaman dilakukan setelah tanaman tersebut terdeteksi oleh upaya pemantauan. Ketika proyek pemberantasan bersama awalnya diusulkan oleh Taman Nasional Podyjí, staf Taman Nasional Thayatal merasa skeptis terhadap efisiensi upaya untuk menghilangkan tanaman invasif berdasarkan pengetahuan mereka tentang banyak upaya pemberantasan yang gagal di daerah lain. Oleh karena itu, Taman Nasional Thayatal hanya mau menginvestasikan sedikit sumber daya pada awalnya untuk menguji apakah upaya pemberantasan akan berhasil. Setelah keberhasilan awal, Taman Nasional Thayatal menyumbangkan sumber daya untuk melakukan tindakan pemberantasan yang lebih besar bersama dengan Taman Nasional Podyjí. Karena kedua taman nasional tersebut menentang penggunaan pestisida, maka setiap tanaman harus disingkirkan dengan tangan dan sebaiknya dilakukan pada saat tanaman masih remaja sebelum benih muncul. Jika tidak, benih dapat menyebar selama pemindahan tanaman dewasa. Namun demikian, tindakan pemotongan terbukti sangat efektif di tempat-tempat yang memiliki stok yang lebih besar.
Proses pemindahan telah dimulai oleh Podyjí sebelum pendirian Taman Nasional Thayatal, yang mengurangi upaya yang diperlukan melalui pemberantasan bersama. Kedua, geomorfologi di bagian lembah sungai yang melintasi taman nasional relatif tidak menguntungkan untuk ekspansi tanaman yang cepat. Ketiga, pemindahan tanaman oleh staf Ceko di tanah Austria menjadi lebih mudah setelah Republik Ceko bergabung dengan Uni Eropa pada tahun 2004. Sebelumnya, polisi perbatasan harus diberitahu setiap kali staf melintasi perbatasan.
Pelajaran besar yang dapat dipetik dari kedua Taman Nasional ini adalah perlunya kerja sama lintas batas negara dan antara dua kawasan lindung untuk bersama-sama menerapkan langkah-langkah konservasi alam. Hal ini terutama diterapkan pada pemindahan spesies invasif di lembah sungai yang terletak di perbatasan.