A MPA em Joal-Fadiouth foi estabelecida em 4 de novembro de 2004. A ideia da conservação dos recursos marinhos e, portanto, do estabelecimento da MPA, surgiu diretamente da comunidade local de pescadores. Juntamente com a comunidade de pescadores, a MPA está sendo co-gerenciada pela Diretoria de Áreas Marinhas Protegidas de Base Comunitária (DAMCP), que foi criada para apoiar as estratégias nacionais de crescimento azul e conservação da biodiversidade do Senegal.
Em 2006, foi criado um Comitê de Gestão que representa todos os grupos de partes interessadas relevantes que são direta ou indiretamente afetados ou envolvidos com a MPA, incluindo pescadores, mulheres que processam peixes, profissionais de turismo ou a polícia. No total, 18 representantes fazem parte do Comitê de Gestão.
A existência de um comitê de gestão que funcione adequadamente desempenhou um papel essencial no desenvolvimento do projeto. Os membros da MPA não queriam ser apenas os anfitriões de um projeto adicional, conduzido por uma ONG externa, mas queriam implementar o mapeamento eles mesmos, a fim de atender às suas necessidades de gerenciamento. Portanto, seu primeiro desafio foi obter conhecimento técnico suficiente para realizar as atividades. O projeto começou com atividades de capacitação, com o apoio da Fundação FIBA para os aspectos técnicos e financeiros e da Rede Regional de MPAs (RAMPAO) para a elaboração do exercício de mapeamento.