Het uitvoeringsprotocol van de programmaovereenkomst bepaalt dat de jaarlijkse financiële kosten van het UNESCO-locatiekantoor en de technisch secretaris moeten worden gedragen door alle institutionele belanghebbenden die de overeenkomst hebben ondertekend, in maatregelen die in verhouding staan tot hun financiële capaciteiten. Dit maakt een duurzame financiële strategie mogelijk op basis van gedeelde bijdragen voor het runnen en onderhouden van twee belangrijke elementen van de bestuurs- en managementstructuur van de site: het UNESCO-locatiebureau en de technisch secretaris. Het jaarlijkse budget - voorzien op ongeveer € 66.000,00 per jaar - wordt gedekt door de bijdrage van elf instellingen (Regio Ligurië, Nationaal Park Cinque Terre, Regionaal Natuurpark Porto Venere, Gemeenten Porto Venere, Levanto (vrijwillig teruggetrokken in 2019), Monterosso al Mare, Pignone, Riomaggiore, La Spezia, Vernazza, Beverino, Riccò del Golfo). Het ministerie van Cultureel Erfgoed en Activiteiten en Toerisme draagt niet direct bij aan het jaarlijkse budget, maar biedt wel verdere technische ondersteuning via zijn technische en wetenschappelijke experts.