Создана структура, обеспечивающая свободу группы от любого внешнего влияния, будь то со стороны правительства, частного сектора, НПО, ученых или МСОП. Члены комиссии могут свободно делать выводы и рекомендации, которые они считают наилучшими, основываясь на последних достижениях науки. Они могут быть свободны в своих мнениях и не имеют никаких договорных отношений по финансированию исследований или других с финансирующей/подрядной стороной или любой другой компанией, работающей на Сахалинском шельфе (включая их материнские или родственные компании и дочерние предприятия).
Сфера деятельности группы определяется набором конкретных, заранее сформулированных вопросов, связанных с охраной природы и управлением природными ресурсами. Члены комиссии обладают необходимыми знаниями и опытом в различных дисциплинах и областях, и от них ожидается, что они будут рассматривать все представленные им данные с строго технической или научной точки зрения.
Независимость РГПДМ имеет ключевое значение для ее способности выполнять функции, ради которых она была создана, и МСОП помогает гарантировать целостность группы. Например, в некоторых случаях, когда группа считала это необходимым, она публично выражала свою озабоченность.