È stata creata una struttura per garantire che il gruppo di esperti sia libero da qualsiasi influenza esterna, sia essa proveniente dal governo, dal settore privato, da ONG, da scienziati o dall'IUCN. I membri del gruppo sono liberi di giungere alle conclusioni e alle raccomandazioni che ritengono migliori sulla base delle più recenti conoscenze scientifiche disponibili. Possono esprimere liberamente le loro opinioni e non hanno alcun accordo contrattuale per il finanziamento della ricerca o altro con il finanziatore/contraente o con altre società che operano sulla piattaforma di Sakhalin (comprese le società madri o sorelle e le filiali).
L'ambito di lavoro del gruppo si basa su una serie di questioni specifiche e predefinite relative alla conservazione e alla gestione delle risorse naturali. I membri apportano le competenze necessarie da diverse discipline e prospettive e sono tenuti a considerare tutte le prove presentate da un punto di vista strettamente tecnico o scientifico.
L'indipendenza del WGWAP è fondamentale per la sua capacità di svolgere la funzione per cui è stato creato e l'IUCN contribuisce a salvaguardare l'integrità del gruppo. In alcune occasioni, ad esempio, il gruppo ha rilasciato dichiarazioni pubbliche di preoccupazione, quando lo ha ritenuto necessario.