Er is een structuur om ervoor te zorgen dat het panel vrij is van externe invloeden van de overheid, de particuliere sector, NGO's, wetenschappers of IUCN. Panelleden zijn vrij om te komen tot wat zij beschouwen als de beste conclusies en aanbevelingen op basis van de meest recente beschikbare wetenschap. Ze kunnen vrij zijn in hun meningen en hebben geen contractuele afspraken voor onderzoeksfinanciering of andere afspraken met de financier/contractant of een van de andere bedrijven die actief zijn op het Sakhalin Shelf (met inbegrip van hun moeder- of zustermaatschappijen en dochterondernemingen).
De reikwijdte van het werk van het panel is gebaseerd op een reeks specifieke, vooraf gedefinieerde vragen met betrekking tot behoud en beheer van natuurlijke hulpbronnen. De leden brengen de vereiste expertise in vanuit verschillende disciplines en perspectieven, en er wordt van hen verwacht dat ze al het bewijsmateriaal dat hen wordt voorgelegd vanuit een strikt technisch of wetenschappelijk oogpunt bekijken.
De onafhankelijkheid van de WGWAP staat centraal bij het vervullen van de functie waarvoor het in het leven is geroepen en IUCN helpt de integriteit van het panel te waarborgen. Bij een paar gelegenheden heeft het panel bijvoorbeeld publiekelijk uiting gegeven aan zijn bezorgdheid, wanneer het dat nodig achtte.