وقد تم اقتراح جبل شدا كملاذ بيولوجي مناخي مرشح بموجب إطار عمل اليونسكو، اعترافًا بدوره الاستثنائي كملجأ للتنوع البيولوجي الجبلي وأهميته لفهم القدرة على التكيف مع المناخ في شبه الجزيرة العربية. وقد تم تسليط الضوء على جبل شدا في التقييمات الإقليمية للاتفاقية الدولية للتنوع البيولوجي والفحص الوطني للاتفاقية الدولية للتنوع البيولوجي (عمل برنامج حماية البيئة البحرية/عمل اتفاقية التنوع البيولوجي في بلانت لايف) كمنطقة نباتية مهمة مؤقتة بسبب ثراء الأنواع العالية والأنواع المتوطنة والمحدودة النطاق ودورها كملجأ للنباتات الجبلية. يدعم الموقع 63 نوعاً من النباتات المستوطنة التي تعد من بقايا النباتات الأفروتوائية. لذلك يعتبر الموقع أولوية للحفاظ على النباتات في الموقع ومراقبتها. تشمل الأنواع النباتية المستوطنة في جبل شدا نباتات تارينا جريفولينز الفرعية ونبات الفربيون. Parciramulosa.

تم إنشاء برنامج رصد منتظم للتنوع البيولوجي لتقييم الغطاء النباتي، ورصد الأنواع النباتية المستهدفة، ومسوحات مصائد الكاميرات للثدييات المتوسطة/الكبيرة الحجم، ومؤشرات صحة النظام البيئي - لتتبع النتائج والسماح باتخاذ إجراءات التكيف. تضع خطة الإدارة الرصد في صميم عملية صنع القرار.

تم تصميم تدابير الحفظ وتنفيذها بالتنسيق الوثيق مع المجتمعات المحلية. وشملت التدخلات إعادة تأهيل المدرجات الزراعية القديمة ذات الجدران الحجرية وتنشيط نظم الزراعة التقليدية، بما في ذلك بساتين البن والفاكهة. وشملت الإجراءات الإضافية تحسين الممارسات الزراعية، وتقديم المساعدة التقنية ودعم وتشجيع البن الشدّاوي (وهو محصول محلي قديم)، إلى جانب تيسير السوق، مما أدى إلى تعزيز سبل العيش المحلية مع الحد من الممارسات الضارة باستخدام الأراضي.

ووضعت قوائم الجرد النباتية (المسوحات الميدانية وتوليف الأدبيات) قائمة مرجعية للأنواع (حوالي 493 نوعاً من النباتات) وحددت مناطق مناخية حيوية صغيرة مرشحة وتجمعات نباتية ذات أولوية للحماية والرصد. كما أُجريت مسوحات للحيوانات شملت أصنافاً مختلفة لبناء برنامج رصد متكامل. كما أن المنطقة المحمية غنية بأنواع الطيور المستوطنة. فمن أصل 17 نوعاً مدرجاً في القائمة، هناك 7 أنواع نادرة من الطيور العربية المستوطنة. وقد سُجلت أسراب كبيرة من طائر منقار الشمع العربي المتوطن استريدا روفيباربا حول المستوطنات وحقول البن. تم الإبلاغ عن ما مجموعه 1408 نوعاً من اللافقاريات من جبل شدا والتي تشمل 45 نوعاً متوطناً

أُعلنت محمية جبل شدا محمية طبيعية خاصة (الفئة الأولى (أ) من الاتحاد الدولي لحفظ الطبيعة والموارد الطبيعية) في عام 2002، بعد مسح استطلاعي أجرته الهيئة الوطنية السابقة للحفاظ على الحياة البرية وتنميتها في عام 2001. وبعد إنشاء المركز الوطني للحياة البرية، تم وضع خطة إدارة جديدة (من المفترض أن يتم تحديثها بعد كل 5 سنوات) تدمج حماية التنوع البيولوجي مع سبل العيش المحلية التي تدعم زراعة البن الشدّاوي والتنمية المجتمعية والسياحة البيئية والرصد المنتظم للتنوع البيولوجي لضمان الحفاظ على هذا النظام البيئي الجبلي الفريد على المدى الطويل. كما تم تسجيل جبل شدا في قاعدة البيانات العالمية للمناطق المحمية (WDPA).

تعتبر تضاريس جبل شدا الوعرة والمتقطعة موطنًا مناسبًا للنمور وهي مدرجة ضمن المناطق التي أعطيت الأولوية للحفاظ على النمر العربي(النمر النمر النمر). النمر العربي مهدد بالانقراض بشكل حرج ومجزأ بشدة في جميع أنحاء شبه الجزيرة؛ وفي حين أن السجلات الحديثة المؤكدة داخل السعودية نادرة أو غائبة، إلا أن جبل شدا لا يزال مهماً كموطن محتمل للنمر وللاتصال في التخطيط الإقليمي. كما تستضيف المنطقة المحمية أيضاً العديد من أنواع الثدييات الأخرى بما في ذلك الثدييات المتوسطة مثل الثعلب الأحمر والكاراكال والضبع المخطط والذئب العربي والجنيت. ولذلك تشمل الإدارة تدابير لحماية موائل الثدييات ومراقبة أي دليل على وجود أفراد متبقية من الفهود. كما تم اتخاذ تدابير للتخفيف من عمليات القتل التجزئة للحيوانات آكلة اللحوم من خلال توعية السكان المحليين والعمل معهم عن كثب.