Perencanaan terpadu lahan basah lintas batas sedang berlangsung dan bertujuan untuk mengembangkan peta jalan untuk penggunaan lahan basah lintas batas secara bijaksana demi integritas ekologi dan ketahanan iklim bagi mata pencaharian. Rencana terpadu lahan basah lintas batas melibatkan inventarisasi lahan basah lintas batas, pemetaan pemangku kepentingan, tantangan ekologi dan sosio-ekonomi lahan basah, tujuan strategis dan intervensi serta perencanaan aksi dan biaya serta pengembangan rencana implementasi multi-pemangku kepentingan dan struktur tata kelola lintas batas yang terkait. Selain itu, intervensi terkait EbA seperti perlindungan daerah sempadan sungai, konservasi tanah dan air di daerah aliran sungai, perlindungan sumber air, dan penghijauan lanskap juga dicakup. Proses bertahap ini meliputi 1) Deskripsi fitur-fitur situs, 2) Evaluasi fitur dan pemilihan fitur kunci, 3) Perumusan tujuan jangka panjang untuk setiap fitur kunci, dan 4) Perumusan tujuan operasional jangka pendek untuk setiap fitur kunci. Pada kasus lahan basah Sio-Siteko (Kenya, Uganda), forum diskusi membantu mengidentifikasi isu-isu kunci di antara para pemangku kepentingan dan visi mereka. Oleh karena itu, tujuan pengelolaan difokuskan pada nilai dan kepentingan para pemangku kepentingan dan bukan hanya pada nilai ekologi.
Kondisi yang memungkinkan termasuk struktur tata kelola lintas batas, niat baik politik dari negara-negara yang terlibat, dan pembiayaan rencana tersebut.
Rencana terpadu lahan basah lintas batas harus dilandaskan pada visi bersama oleh negara-negara yang terlibat, struktur tata kelola lintas batas bersama untuk memastikan tinjauan sejawat dan keberhasilan dari para pihak yang terlibat. Pendanaan berkelanjutan dari rencana tersebut merupakan kunci utama seperti yang dialami dalam rencana lahan basah lintas batas Sio-Siteko.