O planejamento integrado de zonas úmidas transfronteiriças está em andamento e tem como objetivo desenvolver um roteiro para o uso inteligente de zonas úmidas transfronteiriças para a integridade ecológica e a resiliência climática dos meios de subsistência. Os planos integrados de zonas úmidas transfronteiriças envolvem inventários específicos de zonas úmidas transfronteiriças, mapeamento de partes interessadas, desafios ecológicos e socioeconômicos das zonas úmidas, metas estratégicas e intervenções, planejamento de ações e custos e desenvolvimento de um plano de implementação com várias partes interessadas e estrutura de governança transfronteiriça associada. Além disso, são capturadas as intervenções relacionadas à EBA, como a proteção de áreas ribeirinhas, a conservação do solo e da água das bacias hidrográficas, a proteção das fontes de água e a ecologização da paisagem. O processo passo a passo inclui: 1) Descrição das características do local; 2) Avaliação das características e seleção das principais características; 3) Formulação de objetivos de longo prazo para cada característica principal; e 4) Formulação de objetivos operacionais de curto prazo para cada característica principal. No caso das zonas úmidas de Sio-Siteko (Quênia, Uganda), um fórum de discussão ajudou a identificar as principais questões entre as partes interessadas e sua visão. Os objetivos de gestão, portanto, concentram-se nos valores e interesses das partes interessadas e não exclusivamente nos valores ecológicos.
As condições favoráveis incluem estruturas de governança transfronteiriça, boa vontade política dos países envolvidos e financiamento do plano.
Os planos integrados de zonas úmidas transfronteiriças devem estar ancorados em uma visão conjunta dos países envolvidos, em estruturas de governança transfronteiriças conjuntas para garantir a revisão por pares e o sucesso das partes envolvidas. O financiamento sustentável do plano é fundamental, como foi observado no plano de zonas úmidas transfronteiriças de Sio-Siteko.