Gewasrotatie betekent het planten van verschillende eenjarige gewassen in een bepaalde volgorde over meerdere jaren op hetzelfde veld. Gewasrotatie helpt om de vruchtbaarheid van de bodem op lange termijn te verzekeren, aangezien gewassen van verschillende families verschillende behoeften hebben op het vlak van voedingsstoffen en worteldiepte. Bovendien voorkomt het de opeenhoping en verspreiding van ziekten en plagen die in de bodem voorkomen. In Tadzjikistan wordt over het algemeen de voorkeur gegeven aan het telen van dezelfde handelsgewassen, bijv. aardappelen op geïrrigeerd land, boven vruchtwisseling.
Een concept van grondige vruchtwisseling omvat het verbouwen van voederleguminosen zoals luzerne of esparcet gedurende meerdere jaren, die de bodemkwaliteit aanzienlijk verbeteren. Bovendien kunnen peulvruchten (kikkererwten, groene erwten, linzen) worden gebruikt om vruchtwisseling en gewasdiversificatie te bevorderen. Deze kunnen ook als tweede gewas worden geplant. Tegelijkertijd leggen peulvruchten stikstof vast en verbeteren zo de vruchtbaarheid van de bodem. De meeste van deze gewassen trekken bovendien bestuivers aan en bieden geschikte habitats voor bijen.
Veel boeren verdelen hun moestuinpercelen meestal in twee grote delen - één voor aardappelen (omdat dat een van de meest geconsumeerde basisvoedingsmiddelen is) en het andere voor alle andere soorten groenten en kruiden. Omdat de positieve effecten, zoals een hogere opbrengst en minder plagen en ziekten, meteen zichtbaar zijn, zijn boeren in Tadzjikistan meestal bereid om vruchtwisseling in hun moestuinen in te voeren.
In Tadzjikistan wordt aan vruchtwisseling gedaan, maar niet op een systematische en grondige manier. Helaas zijn de meeste boeren niet in staat om volledige vruchtwisselingssystemen toe te passen, inclusief de teelt van voedergewassen en groenbemesters, omdat de beschikbare grondbronnen beperkt zijn. Daarom zijn boeren verplicht om eerder onmiddellijke effecten te krijgen in plaats van volledige vruchtwisselingssystemen toe te passen die de bodemvruchtbaarheid op lange termijn in stand houden.
Het telen van een tweede gewas als vruchtwisseling is alleen mogelijk als er voldoende irrigatiewater beschikbaar is en de vegetatieperiode lang genoeg is om het tweede gewas te laten rijpen.