Вода в мангровом лесу должна обновляться и быть хорошего качества (соленость, растворенный кислород, pH), чтобы мангры и организмы, являющиеся частью мангровой среды обитания, процветали, например рыбы, губки, анемоны и мангровые устрицы. Силой, обеспечивающей циркуляцию воды, является приливное течение; рек, питающих мангры, не существует. Вода движется через корни в виде листового потока, по каналам и лагунам. Рост корней и накопление отложений снижают способность системы своевременно доставлять воду во все части мангрового леса, особенно в ту часть, которая наиболее удалена от открытого океана и испытывает наибольший стресс.