红树林中的水需要清爽且水质良好（盐度、溶解氧、pH 值），这样红树林和作为红树林栖息地一部分的生物（如鱼类、海绵、海葵和红树林牡蛎）才能繁衍生息。 水循环的动力是潮汐流；没有河流为红树林提供水源。根系的生长和沉积物的积累削弱了该系统将水及时输送到红树林各个部分的能力，尤其是离公海最远的部分承受的压力最大。