MAR Liderlik programı, yeni proje fikirlerini Mezoamerikan Resif Ekolojik Bölgesi boyunca çoğaltma (ölçek büyütme) potansiyeli olan projelere dönüştürmeyi amaçlamaktadır. Bu projeler 3-5 yıllık bir zaman dilimi içerisinde net ve ölçülebilir koruma etkileri gösterecek şekilde geliştirilmektedir. Her kohort, bölgenin koruma ihtiyaçlarıyla bağlantılı tematik bir odağa sahiptir. Örneğin, 2010 yılında bursiyerlerin projeleri kıyı gelişimi ve turizm; 2011 yılında sürdürülebilir balıkçılık ve Deniz Koruma Alanlarının (MPA) kurulması; 2012 yılında çok işlevli deniz rezervleri ağının kurulması; 2014 yılında entegre katı atık yönetimi ve 2015 yılında mangrov ekosistem hizmetlerinin korunması ve ekonomik değerlemesi üzerine odaklanmıştır.