中美洲珊瑚礁生态区领导力计划旨在将新的项目理念培育成有可能在中美洲珊瑚礁生态区推广（扩大）的项目。这些项目的开发目的是在 3-5 年的时间跨度内显示出明确和可衡量的保护影响。每批学员都有一个与该地区保护需求相关的专题重点。例如，2010 年，研究员的项目侧重于沿海开发和旅游业；2011 年，侧重于可持续渔业和建立海洋保护区（MPA）；2012 年，侧重于建立多功能海洋保护区网络；2014 年，侧重于固体废物综合管理；2015 年，侧重于红树林生态系统服务的保护和经济评估。