图自 Lewis 等人（2003 年）的论文。利用空间分析和地理信息系统技术重新划分大堡礁海洋公园。
Lewis et al. (2003)
决策支持系统/工具的使用和局限性
图中显示了符合规划原则的 GBR Marxan "最终 "成果之一（A），以及它与规划草案（B）和最终分区规划（C）之间的差异，两者都必须考虑其他社会和政治因素。
Pressey et al.2012
决策支持系统（DSS）或分析工具，如 Marxan 或 SeaSketch，经常被宣传为有效进行海洋空间规划的先决条件，为规划问题提供快速可靠的解决方案。设计支持系统的用户自然希望使用设计支持系统能产生 "答案"，从而为他们的规划问题提供解决方案。通常情况下，设计支持系统产生的结果比较简单，需要使用其他规划方法进行修改。所有的设计支持系统工具都有局限性，无法弥补缺失或不完整的数据。它们可能会产生意想不到的副作用，而且往往无法与现实世界规划问题的复杂性相匹配。如果不考虑社会、文化和经济价值，规划结果就没有什么实际价值--然而，这些数据很少能以适合 DSS 的形式或适当的空间分辨率随时提供。在 GBR，DSS 生成了各种 "禁捕 "区选项的 "足迹"，但它无法满足八种区域类型的要求，因此需要采用其他规划方法。然而，真正的好处是能够生成指标，为制定最佳的禁渔分区网络提供依据。
Marxan 由昆士兰大学开发，是 SPEXAN 的改进版，以满足 GBRMPA 在代表性区域计划和 2003 年分区规划制定期间的需求。下图显示，Marxan 并未生成 GBR 的最终分区网络，但通过对各种方案的事后核算，它确实提供了宝贵的决策支持，使人们能够快速评估每种方案对每个规划目标的影响。
在现实中，设计支持系统无法进行规划最后阶段不可避免的微调和政治权衡，因此它永远无法为任何规划任务提供最终的务实解决方案。设计支持系统的一些不足之处是
- 有些规划信息，特别是社会经济数据，可能不容易应用到设计支持系统中。
- 虽然设计支持系统可能会生成一个 "解决方案"，但如果/当引入社会经济价值时，它就不可避免地会被改进。这些价值往往在数据中没有体现，但往往是社会可接受结果的一些最基本的价值。
- 糟糕的数据总是会导致糟糕的结果。
- 大多数当代 DSS 工具都不可能满足用户的所有需求；在 GBR 规划项目中，即使是简单的 "规则"，如 "所有保护区的面积不应小于......"，也无法直接通过 DSS 实现。
- 一些利益相关者对他们不了解的 "黑箱 "模型或 DSS（如 Marxan 或 Seasketch）持谨慎态度。