

Perbedaan antara zonasi berdasarkan tujuan dan zonasi berdasarkan aktivitas paling baik dijelaskan dengan contoh; zona 'tanpa pukat' mungkin menunjukkan dengan jelas satu aktivitas yang dilarang (yaitu semua pukat dilarang di zona itu), tetapi mungkin tidak jelas tentang aktivitas lain yang mungkin diizinkan atau tidak diizinkan. Tujuan Zona Perlindungan Habitat memungkinkan berbagai kegiatan yang memiliki dampak (relatif) minimal terhadap habitat bentik terjadi di dalam zona tersebut; misalnya, berperahu, menyelam, dan penelitian dengan dampak terbatas diperbolehkan, serta mengizinkan beberapa kegiatan ekstraktif seperti pancing, menjaring, memancing, dan memancing dengan tombak (yaitu, beberapa tetapi tidak semua, kegiatan penangkapan ikan). Namun, tujuan zona dan ketentuan zonasi terkait dengan jelas melarang pukat dasar, pengerukan, atau aktivitas lain yang merusak habitat sensitif di zona tersebut. Di sebagian besar lautan, ada banyak kegiatan laut yang ada atau potensial yang perlu dikelola, tetapi banyak dari kegiatan ini saling melengkapi dan dapat terjadi di dalam zona yang sama; jika zonasi digunakan untuk menangani semua kegiatan yang ada (dan zonasi laut tentu saja merupakan salah satu alat penting untuk melakukannya), maka lebih baik zonasi dibuat berdasarkan tujuan daripada berdasarkan masing-masing kegiatan.
Rencana Zonasi adalah dokumen hukum yang mencakup semua rincian spesifik zonasi (misalnya tujuan zona (lihat Sumber Daya di bawah ini), batas-batas zona yang terperinci, dll.). Undang-undang memberikan 'kepala kekuasaan' untuk menyiapkan rencana zonasi dan mencakup bagian tentang Interpretasi rencana zonasi (bagian 3A) dan rincian tentang objek zonasi, apa yang harus ada dalam rencana zonasi dan bagaimana rencana zonasi harus disiapkan (bagian 32-37A).
- Jika tujuan zona memiliki beberapa bagian, maka harus ada hirarki yang jelas di dalam tujuan tersebut. Sebagai contoh, jika tujuannya adalah untuk konservasi dan pemanfaatan yang wajar (seperti yang ditunjukkan pada sebagian besar zona GBR - lihat Sumber Daya di bawah), bagian kedua selalu tunduk pada bagian pertama (yaitu pemanfaatan yang wajar hanya dapat terjadi jika tunduk pada konservasi).
- Rencana Zonasi GBR juga memiliki ketentuan izin 'catch-all' khusus dalam ("tujuan lain apa pun yang konsisten dengan tujuan zona..."). Hal ini memungkinkan adanya teknologi atau kegiatan baru yang belum diketahui ketika Rencana Zonasi disetujui. Hal ini memberikan 'jaring pengaman' yang penting yang memungkinkan suatu kegiatan yang tidak termasuk dalam salah satu dari dua daftar yang dijelaskan dalam BB1 untuk tetap dipertimbangkan untuk mendapatkan izin asalkan konsisten dengan tujuan zona.