ハート・オブ・ネオリシック・オークニーの世界遺産は、スコットランド歴史環境局（HES）、オークニー諸島評議会（OIC）、ハイランズ＆アイランズ・エンタープライズ（HIE）、オークニー・カレッジ・ハイランズ＆アイランズ大学（UHI）考古学研究所、ネイチャースコット（旧スコティッシュ・ナチュラル・ヘリテージ-SNH）、王立鳥類保護協会（RSPB）の代表で構成される統合・共同運営グループによって管理されている。HESはWHSを構成する個々のモニュメントを管理し、他のパートナーは様々な形でWHSと緩衝地帯のより広い管理に関わっている。WHSコーディネーターは、パートナー間の効果的な連携を確保し、管理計画と関連する行動計画の実施、監視、改訂を推進し、WHSのOUVと公益を促進し、パートナー、利害関係者、一般市民の認識と理解を深め、アドバイスの中心的な役割を果たす。

さらに、運営グループは、モニュメントとより広い景観との関係やつながりを確実に保護する責任も担っている。世界遺産を構成するモニュメントと、その外側のOUVを支える地域のモニュメントとの間の地域は、田園地帯の変化や開発から潜在的に危険にさらされている。