このガバナンス機構は、ブルーエコノミーに関する共通のアジェンダをめぐる継続的かつ定期的な地域対話を保証し、支援するために、様々なレベルで設計されている。

特に、ブルーエコノミー作業部会、ステークホルダー会議・イベント、地中海ブルーエコノミー・ステークホルダー・プラットフォームの3つを中心に構成されている。

定評のあるUfMブルーエコノミー作業部会は、年に1～2回開催される。UfM事務局が会議の運営を担当し、メンバー国1カ国につき最大2名の参加者と、様々なステークホルダー（管理当局、国際金融機関、学界、地方自治体など）の代表者が参加する。パートナー間の定期的なコミュニケーションにより、プロジェクト活動全体の実施中、機関間のパートナーシップが効果的に機能することが保証される。グループの主な任務は以下の通り：

• 閣僚宣言の実施全体をレビューする；
• 地域および国内の進展についてグループに報告する；
• 意見と情報の交換
• 実施プロセスを検討し、潜在的に生じうる必要な変更について決定を下す；
• 主なプロジェクトの期待成果と成果を再検討する；
• 他の関連する国・地域・世界のイニシアティブとの連携を強化するための方策を提案する。