La création d'un fonds permanent destiné à couvrir les dépenses de gestion des zones protégées a aidé les administrations gérées par le gouvernement à disposer d'un budget annuel pour couvrir leurs principales activités opérationnelles, comme c'est le cas de la réserve de faune et de flore sauvages de Cuyabeno.
Ce fonds, officiellement connu sous le nom de Protected Areas Fund (PAF), a été créé dans le cadre d'une initiative lancée en 1999 par le ministère équatorien de l'environnement et le Fonds national pour l'environnement, avec le soutien d'organisations internationales. L'objectif principal était de diversifier les sources de financement des zones protégées publiques et d'assurer des ressources financières à long terme.
Le Fonds national pour l'environnement, créé en 1996, a servi de précédent au PAF. Il était considéré comme "un mécanisme financier indépendant disponible pour soutenir les plans, les programmes, les projets et toute activité visant la protection, la préservation et l'amélioration de l'environnement et des ressources naturelles". Ce fonds, créé en tant qu'organisation privée, administrait et canalisait les ressources financières, fournissait des conseils techniques, mais ne participait pas à la mise en œuvre directe d'une initiative.
- Des politiques nationales ont été mises en place pour soutenir la création d'un fonds environnemental national, destiné à assurer la stabilité budgétaire du système national équatorien de zones protégées.
- Soutien financier constant de la part des agences de coopération nationales et internationales pour créer un fonds fiduciaire destiné à couvrir les coûts opérationnels et de gestion des zones protégées gouvernementales, y compris la réserve de faune et de flore de Cuyabeno.
La conception et la mise en œuvre du PAF sont le résultat d'un processus de négociation entre le gouvernement équatorien, la société civile et les agences internationales.
Son principal objectif est de fournir un soutien et une stabilité financière au système national équatorien des zones protégées, contribuant ainsi à la conservation in situ de la biodiversité de l'Équateur. Le PAF est destiné à cofinancer les dépenses opérationnelles de base et à fournir un soutien technique.
Après une interruption d'un an en 2015, le PAF travaille actuellement avec 30 aires protégées gouvernementales, dont la réserve sauvage de Cuyabeno, qui dispose d'un budget annuel de 56 000 USD. Même si le PAF n'est pas le seul mécanisme financier dont dispose la réserve, le budget annuel qu'il couvre soutient les principales activités opérationnelles de l'aire, qui sont alignées sur les objectifs stratégiques et les résultats proposés dans le plan opérationnel annuel.