保護地域の管理費を賄うための恒久的な基金の設立は、クヤベノ野生生物保護区のように、政府が管理する行政機関が主な運営活動を賄うための年間予算を確保するのに役立っている。

この基金は正式には保護地域基金（PAF）と呼ばれ、1999年にエクアドル環境省と国家環境基金が主導して設立された。主な目的は、公的支援による保護地域の財源を多様化し、長期的に財源を確保することであった。

1996年に設立された国家環境基金は、PAFの主な前例となった。これは「環境と自然資源の保護、保全、改善を追求する計画、プログラム、プロジェクト、あらゆる活動を支援するために利用できる独立した財政メカニズム」と考えられていた。民間組織として設立されたこの基金は、資金を管理・配分し、技術的なカウンセリングを行ったが、いかなるイニシアチブの直接的な実施にも関与しなかった。