De oprichting van een permanent fonds om de beheerskosten in beschermde gebieden te dekken, heeft de door de overheid beheerde administraties geholpen om een jaarlijks budget te hebben om hun belangrijkste operationele activiteiten te dekken, zoals het geval is in het Cuyabeno Wildlife Reserve.
Dit fonds staat officieel bekend als het Fonds voor Beschermde Gebieden (PAF) en werd in 1999 opgericht als onderdeel van een initiatief van het Ecuadoraanse Ministerie van Milieu en het Nationale Milieufonds, het initiatief werd ook gesteund door internationale organisaties. Het belangrijkste doel was om de financiële bronnen voor door de overheid gesponsorde beschermde gebieden te diversifiëren en de financiële middelen op lange termijn veilig te stellen.
Het Nationaal Milieufonds dat in 1996 werd opgericht, diende als de belangrijkste voorloper van het PAF. Het werd beschouwd als "een onafhankelijk financieel mechanisme ter ondersteuning van plannen, programma's, projecten en alle activiteiten die gericht zijn op de bescherming, het behoud en de verbetering van het milieu en de natuurlijke hulpbronnen". Dit fonds, opgericht als een privé-organisatie, beheerde en kanaliseerde financiële middelen, gaf technisch advies, maar nam niet deel aan de directe uitvoering van initiatieven.
- Nationaal beleid ter ondersteuning van de oprichting van een Nationaal Milieufonds, ontworpen om budgettaire stabiliteit te bieden aan het Ecuadoraanse nationale systeem van beschermde gebieden.
- Constante financiële steun van nationale en internationale samenwerkingsagentschappen om een trustfonds te creëren dat bedoeld is om de operationele en beheerkosten van de door de overheid beschermde gebieden te dekken, waaronder het Cuyabeno Wildlife Reserve.
Het ontwerp en de implementatie van het PAF waren het resultaat van een onderhandelingsproces tussen de Ecuadoraanse regering, de burgermaatschappij en internationale agentschappen.
Het belangrijkste doel is om steun en financiële stabiliteit te bieden aan het Ecuadoraanse systeem van nationale beschermde gebieden en zo bij te dragen aan het behoud in situ van de Ecuadoraanse biodiversiteit. Het PAF is bedoeld om operationele basisuitgaven mede te financieren en technische ondersteuning te bieden.
Na een onderbreking van een jaar in 2015, werkt het PAF momenteel samen met 30 door de overheid beschermde gebieden, waaronder het Cuyabeno Wildreservaat dat een jaarlijks budget van 56.000 USD toegewezen krijgt. Hoewel het FAP niet het enige financiële mechanisme is dat het reservaat heeft, ondersteunt het jaarlijkse budget de belangrijkste operationele activiteiten van het gebied, die zijn afgestemd op de strategische doelen en resultaten die zijn voorgesteld in het jaarlijkse operationele plan.