Beheren zonder gerichte doelstellingen is als geblinddoekt autorijden. Doelstellingen helpen om te bepalen hoe effectief het huidige beheer is, welke gebieden actief beheer nodig hebben en of de ondernomen acties bijdragen aan het bereiken van de doelstellingen van het systeem. We ontwikkelen een uitgebreide reeks ecologische en sociale indicatoren, laten deze prioriteren door regionale sociale en ecologische wetenschappers en werken samen met beheerders om onafhankelijk van elkaar indicatoren te prioriteren en doelstellingen te ontwikkelen rond elk beheerdoel. De uiteindelijke lijst bevat de prioriteiten van beheerders en wetenschappers en wordt getoetst door belanghebbenden en regionale wetenschappers. De lijsten met doelstellingen zijn flexibel en worden vaak bijgewerkt. Bij gebrek aan gegevens of analysecapaciteit helpen we hen bij het uitvoeren van een literatuuronderzoek en het vaststellen van ecologische doelen met behulp van basisgegevens (bijv. historische status of status binnen referentiegebieden van lang beschermde MPA's), niet-lineariteit in grote datasets (d.w.z. drempelniveaus waarop de toestand van het ecosysteem verandert) of vastgestelde doelniveaus (bijv. niveaus die door overheden zijn vastgesteld). Voor doelen voor de sociale toestand werken we samen met beheerders en belanghebbenden en gebruiken we referentierichtingen (verbetering ten opzichte van de bestaande toestand) of normatieve (op waarden gebaseerde) doelen.