Заповедник Яигохе Апапорис был создан в 1998 году по просьбе коренных народов Танимука, Юкана, Летуама, Матапи, Кабаяри, Макуна, Баразано и Юджуп-Маку. В 2008 году на внеочередной сессии традиционных властей и капитанов коренных народов (ATCI) эти общины пришли к консенсусу и решили просить о создании национального парка, который бы перекрывал границы заповедника. В основе просьбы лежало соображение, что это позволит исключить развитие горных разработок и других видов эксплуатации природных ресурсов, которые могут поставить под угрозу биоразнообразие, священные места и, как следствие, их обычаи, социальный состав и экологический контекст.

Создание заповедника коренных народов Яигоже Апапорис и природного национального парка - это длительный процесс сотрудничества с Фондом GAIA Amazonas, который получил техническую и финансовую поддержку Фонда Гордона и Бетти Мур. Решение о переходе к специальному режиму управления (REM) должно было получить полную поддержку местных жителей, обеспечить автономию коренных общин и укрепить их традиционные системы. Кроме того, им необходимо было обладать навыками ведения переговоров и координации, чтобы заключить соглашение с государством.