在纪伊山圣地被指定为文化遗产和自然遗产（作为国家公园的一部分），后来又被纳入生物圈保护区，最后成为世界遗产的一部分的整个过程中，宗教团体根据数百年来基于宗教信仰和神圣价值的传统知识，被正式授权对其进行保护和管理。例如，由于原始森林的神圣性，不同宗教团体对其进行了严格的保护，禁止砍伐。 ，山地景观被真言宗佛教徒解释为具体化的 "曼陀罗"，修道者通过在这些自然环境中朝圣和苦修来再现 "曼陀罗"。对于朝圣者来说，纪伊山代表着人间天堂。另一个例子是那智神林，根据《文化财产保护法》，它被指定为 "天然纪念物"，由熊野那智神社负责管理，是其圣地的一部分。那智瀑布被视为圣水。这意味着圣水不能被触动或挪作他用。