La coordinación del proyecto ha venido conformando una alianza con gobiernos locales, centros de investigación y organizaciones de base con presencia específica en cada una de las cuencas del proyecto para asegurar una comunicación directa con los productores y otros actores del territorio. Gracias a la red de ONGs locales, se ha producido un mayor impacto en los talleres de presentación de información y resultados a los productores y a hacer una traducción eficaz de los diagnósticos a la realidad en campo. Ejemplos de este apoyo en el territorio incluyen: i) el manejo de intereses diferentes y de potenciales conflictos entre actores en el PN Cofre de Perote; ii) creación de sinergias por parte de las instituciones  a nivel de gobierno, a través de sus programas de asistencia social, de subsidios, dirigidos a ciertos lugares que coinciden con el proyecto; iii) establecimiento de líneas de trabajo coordinadas desde nivel gobierno, desde ANP hasta las OSC; iv) coalición entre OSC podían tener más impacto en el territorio, reducir costos; aprovechar las diferentes capacidades de los diferentes actores y potenciar el impacto de las acciones.

Como parte de la planeación territorial integral entre las subunidades dentro de las cuencas, los PAMIC consideran las dinámicas de transformación del paisaje y buscan identificar y conservar los elementos clave del ecosistema, tanto naturales como antrópicos. En la filosofía de los PAMIC, conservar no significa “no tocar” aquellos ecosistemas saludables, sino que interesa fomentar y sembrar la idea de que la conservación no es sólo para los ecosistemas naturales conservados o vegetación secundaria sino también incluye recuperar y usar aquellas prácticas y técnicas que permiten un buen uso del territorio como seria en café de sombra, el manejo forestal sustentables. Estas prácticas son también consideradas como elementos clave del ecosistema y son prácticas que van más allá de conservar sólo por conservar. Por ejemplo, un manejo agrosilvopastoril implica no extender el área de pastoreo sino, concentrar en el territorio un manejo más integrado, en el cual tenemos en un mismo territorio, mejores rendimientos y mayores impactos. Estamos beneficiando a los ecosistemas y a la economía local que hace un buen uso del territorio, suelo, servicios ambientales.

El programa incluye trabajar con los egresados quienes se convierten en "fellows" del programa y son quienes ayudan a la siguiente generación.

Si bien todos los participantes entraban en un programa de capacitación, los ganadores se ganaban un viaje extraordinario a La Antártida, para lo cual también tenían que preparar su mente y su cuerpo.

En ese viaje también aprendían tanto de los científicos que llevan a cabo trabajos de monitoreo en la estación climática, como del sitio. Ahí veían cómo todo está conectado y que sus proyectos locales tenían un impacto en el clima a nivel global.

La transformación del aprendizaje significativo viene justamente cuando los elementos del conocimiento y el
contacto con la naturaleza convergen en los participantes, incluyendo 4 valores claves:1) Formación del carácter, 2) Orden, 3) Respecto y 4) Unidad

Cada actividad, cada expedición lleva consigo el reforzar el aprendizaje de los participantes, con esquemas sensoriales y emotivos.

Lanzar una convocatoria para escuelas públicas en la Cd de México para que 5 niños y un alumno propusiera un proyecto ambiental para sus escuelas.

En 2011 se realizó un estudio de capacidad de carga (buceo libre y autónomo) en Cabo Pulmo a cargo de la Universidad Autónoma de Baja California Sur (UABCS), financiado por Amigos para la Conservación de Cabo Pulmo (ACCP) y apoyado por los Prestadores Turísticos (PST). Dicho estudio estableció las bases del Programa de Uso Público y sus resultados se discutieron y modificaron con base en la experiencia de todos los actores. En 2014 se instaló el Subconsejo de Uso Público, el cual está conformado por la CONANP, los PST, Niparajá y la UABCS. Dentro de las reglas acordadas está un sistema de avisos en donde los PST informan a CONANP sobre cada uno de sus viajes por medio del radio VHF, en tiempo real, registrando el número de turistas y los sitios que visitarán. En las reuniones del Subconsejo de Uso Público también se definió el número máximo de embarcaciones de manera simultánea por sitio, con la finalidad de que no se presente una saturación de embarcaciones, así como otros acuerdos relacionados con el manejo de las actividades turísticas. Durante 2016 realizamos la evaluación del cumplimiento de las reglas; de los 55 acuerdos el 90 % eran implementados y respetados por los PST. La participación activa de los prestadores desde el origen de las reglas ha garantizado el amplio cumplimiento de las mismas.