L'université de Perpignan est un partenaire historique de la Réserve et certains universitaires sont membres du Conseil Scientifique de la Réserve et interviennent régulièrement dans de nombreux suivis. Ils ont participé à la rédaction du dernier plan de gestion 2015-2019 permettant ainsi de maîtriser les attentes du gestionnaire et les réponses aux différentes problématiques rencontrées. La proximité avec le site permet de faire de la Réserve un véritable laboratoire à ciel ouvert pour ces chercheurs. L'université de Perpignan avait déjà effectué la cartographie des substrats rocheux en 3 D de la Réserve avec une précision à 30 cm près (voir PJ). Cette cartographie a permis de mieux connaitre la zone et adapter les moyens mis en oeuvre pour obtenir des résultats d'une telle précision. De part cette connaisssance du terrain, la maitrise de ce matériel techologique et les attentes du gestionnaie à travers un cahier des charges précis ont permis d'obtenir un chiffrage adapté et juste pour la réalisation de ce suivi.

La faible profondeur près de la côte exclu l’utilisation du sonar dans ces zones qui disposent d’une transparence de l’eau suffisante pour permettre la télédétection. Afin de compléter la cartographie des petits fonds côtiers lors de ce suivi, l’utilisation d’un drone Phantom 4MD lors d’une sortie a permis une interprétation claire de la zone de Peyrefite en termes de posidonie, notamment par la faible profondeur. Une seconde sortie a permis l’obtention d’autres orthophotos le long de la côte « des Tynes ». Par manque de temps et à cause de mauvaises conditions météorologiques, la zone de Pin Parasol ne bénéficie pas d’orthophotos. L’utilisation du drone a permis l’obtention d’une orthophoto faisant apparaître avec précision des herbiers ou matte morte par transparence de l’eau.

Il est indispensable de fédérer les partenaires pour atteindre une bonne gestion de l'environnement. Pour cela, il est nécessaire de : 

- identifier tous les conflits d'usages

- associer les usagers dans les partenaires : scientifiques, communautés locales, gestionnaires d'espaces protégés, fédérations de pêche, etc.

Entre 2015 et 2019, la Direction du Parc National de Toubkal (DPNT) a élaboré des fiches de collecte de données pour le suivi i) des infractions liées aux activités touristiques, et ii) de la faune sauvage.

Il s'agit de fiches sous format papier remises aux éco-gardes locaux et qu'ils doivent remplir lors de leurs prospections de terrain, illustrer par des photographies et remettre ensuite aux Chefs de Zones du Parc National de Toubkal (PNTb) : à partir de ces fiches, ces derniers élaborent alors pour la DPNT des rapports trimestriels et des cartes de localisation, qui alimentent une base de données.

A partir de la fin octobre 2019, la DPNT envisage d'améliorer et de faciliter pour les éco-gardes locaux la collecte de données : le chargé de l'écotourisme au Parc National de Toubkal, en collaboration avec le chargé du suivi scientifique et les Chefs de Zones du PNTb, a ainsi adapté pour cette aire protégée le logiciel CyberTracker afin de développer une application mobile, facile d'utilisation, pour réaliser le monitoring dans le Parc National de Toubkal. Une formation pour l'utilisation de cette appli est prévue très prochainement au profit des éco-gardes du PNTb.

Lors de ce suivi, la vedette de la Réserve Naturelle a été mise à disposition afin de pouvoir étudier les petits fonds côtiers. D'une longueur de 8 mètres
elle est équipée d’un sondeur, d'un GPS et d'un radar. Afin de compléter ce matériel et obtenir une précision la plus fine possible, la vedette a été équipée pour ce suivi d’un GPS différentiel fonctionnant en mode WAAS/EGNOS métrique temps réel, avec une précision de l’ordre de 1 à 2 mètres. Pour plus de précision lors des investigations menées lors de la cette campagne, un système RTK (Real Time Kinematic = cinématique temps réel) a été utilisé. Sa balise a été placée sur le toit du sémaphore du Cap Béar, proche de la zone étudiée. Il s’agit d’une méthode où des corrections du signal GPS sont transmises en temps réel à partir d’un récepteur de référence, implanté sur un point connu précis, vers le récepteur mobile du bateau. On peut alors avoir une précision de
l’ordre du centimètre si l’on se trouve à proximité du récepteur de référence.

Depuis plusieurs années, de nombreuses études sur les herbiers de posidonies ont été réalisées dans la Réserve. Chaque étude permettait d'acquerir des résultats de plus en plus précis tout en laissant un certains nombres de manques. La Réserve a alors souhaité combler ces manques grâce à l'utilisation simultanée de plusieurs systèmes innovants comme le sonar à balayage latéral (SBL). Ce sonar a donné un aperçu des caractéristiques du fond marin. L’intégration des données de Systèmes Acoustiques de Classification Automatique des Fonds (SACLAF) de missions antérieures dans ce projet aura été un moyen complémentaire au système d’imagerie acoustique par balayage permettant d’apporter un élément de validité des données. La fiabilité des résultats a été estimée par l’utilisation de caméras GoProMD. L’ensemble des données a été traité sous le logiciel de traitement des données géographiques, ArcGIS version 10.3.