O processo de negociação consiste em três aspectos principais:

• Organização da parceria: isso começa com a consulta a todas as partes interessadas sobre o conceito de cogestão. Quando eles entenderem e perceberem a necessidade de criar a parceria de cogestão entre os atores, eles devem se organizar para estarem prontos para a negociação do acordo. O aspecto da organização é essencial para transformar indivíduos passivos da comunidade em um grupo organizado com uma visão comum e para garantir um alto nível de participação.
• Negociar o acordo de cogestão e a instituição de governança compartilhada: Essa é a prática de compartilhamento de poder entre os atores. Por meio da negociação, diferentes atores expressam suas preocupações e contribuem com suas ideias sobre como os recursos naturais devem ser gerenciados e conservados. Também são negociadas questões de governança, como quem pode tomar decisões e quais são as responsabilidades e prestações de contas de cada ator.
• Aprender fazendo: o processo de negociação não é um processo linear, mas sim um ciclo em espiral de implementação do acordo, sustentando o funcionamento da instituição de governança compartilhada, continuando o monitoramento e a análise de seus resultados e impactos ao longo do tempo e fornecendo insumos para a renovação do acordo.

A aprendizagem em grupo, o feedback entre pares e os intercâmbios entre pares estão incorporados no projeto do programa de Liderança do MAR, juntamente com oportunidades contínuas de networking virtual para permitir que os bolsistas desenvolvam um grupo de apoio para seus projetos atuais e sua paixão contínua pela conservação do Recife Mesoamericano. A Liderança do MAR busca uma rede consolidada e ativa de Liderança do MAR, na qual os bolsistas colaborem entre si e com especialistas, comunidades, governos e instituições acadêmicas, independentemente das fronteiras. O estabelecimento de conexões entre disciplinas, organizações e fronteiras geográficas tem sido fundamental para a missão do MAR-Leadership.

A capacidade dos líderes locais de conservação é fortalecida para que eles se tornem mais eficazes na elaboração e na implementação de seus projetos de conservação, de modo que possam servir aos bolsistas desse programa durante toda a sua vida.

O Programa de Liderança do MAR oferece treinamento individual e em grupo:

Durante os workshops em grupo, os bolsistas são treinados na elaboração de projetos e suas habilidades de liderança são refinadas. As competências visadas incluem o desenvolvimento de estratégias de comunicação eficazes, falar em público, negociação e resolução de conflitos, gerenciamento de tempo e liderança no gerenciamento de equipes.

Para o treinamento individual, os bolsistas têm acesso a um pequeno orçamento que pode ser usado para participar de cursos ou programas de diploma técnico, aulas intensivas de inglês ou espanhol, visitas a mentores, visitas a projetos-piloto, estágios em organizações internacionais que lidam com tópicos associados ao projeto do bolsista, bem como a produção de estudos de mercado e geração de dados para reforçar a viabilidade do projeto de um determinado bolsista. Esses fundos são gastos de acordo com um plano de treinamento elaborado com contribuições da equipe do programa e de especialistas internacionais.

A existência de estruturas políticas sólidas facilita o projeto e a implementação de iniciativas locais e nacionais de carbono azul. Essas políticas promovem o apoio oficial do governo e a base para funções institucionais, além de oferecerem vínculos com outras políticas, mecanismos e estratégias nacionais e internacionais (como NDCs, REDD+ e NAMAs). O processo de criação de políticas começa com consultas informais às autoridades nacionais para mapear os atores, avaliar seu interesse e obter seu apoio. Como se trata de construções em escala nacional, é importante que haja aconselhamento estratégico e facilitação do processo.

Em 2015, a pesca do pargo de Bejuco foi submetida a uma avaliação completa pelo Marine Stewardship Council (MSC). No entanto, o processo de certificação foi interrompido em 2016 devido a sérias deficiências de governança nacional. Devido à dificuldade de muitos pescadores de pequena escala em satisfazer os rigorosos requisitos do MSC, a Fair Trade USA desenvolveu um Programa de Pesca de Captura que combina os padrões ambientais do MSC com requisitos sociais robustos. O processo de certificação é gradual e permite que os pescadores desenvolvam as ferramentas necessárias para cumprir as exigências da norma em um período de seis anos, em vez de todas de uma vez no momento da avaliação, como exige o MSC. O processo de Comércio Justo aborda melhor as realidades sociais e de gerenciamento nas quais a maioria das pescarias artesanais opera. Por isso, os pescadores e as partes interessadas da cadeia de valor iniciaram uma pré-avaliação inicial do Comércio Justo da pescaria. O bloco de construção da certificação dessa solução passou por muitas mudanças ao longo dos anos, mas os membros do projeto sentem que estão avançando em direção a melhorias socioeconômicas viáveis e de longo prazo que, desde o início do processo do MSC, têm sido a força motriz por trás da iniciativa de certificação.

Para desenvolver e gerenciar uma pescaria ambientalmente sustentável, é necessário estabelecer vários indicadores de desempenho para suas espécies-alvo, espécies comuns de captura acessória, fatores ambientais e regimes de gerenciamento. Exemplos desses indicadores para a pesca artesanal com palangre de fundo de Bejuco incluem o status do estoque, as taxas de captura acessória e de descarte, as taxas de captura de espécies ameaçadas e/ou protegidas, os impactos dos equipamentos no fundo do mar e nos organismos bentônicos associados, o plano de gerenciamento local e a capacidade nacional de gerenciamento da pesca. Desde 2007, a composição da captura da pesca com palangre de fundo em Bejuco tem sido continuamente monitorada por observadores e pesquisadores que acompanham os pescadores em suas viagens noturnas. Essas informações, juntamente com a coleta de conhecimento ecológico dos pescadores, permitiram que os pesquisadores identificassem muitos desses indicadores. Em estreita colaboração com o governo nacional, iniciativas de desenvolvimento de áreas protegidas e planos de gerenciamento também estão tomando forma.

As avaliações rurais participativas ajudam a traçar um panorama da situação socioeconômica e ambiental e das principais preocupações. As avaliações geográficas e o uso de sistemas de informações geográficas ajudam a identificar a área do projeto e as zonas de risco mais afetadas pelos impactos das mudanças climáticas, como o aumento do nível do mar e a salinidade.