Müzakere süreci üç temel unsurdan oluşur:

• Ortaklık için örgütlenme: Bu, ortak yönetim konsepti hakkında tüm paydaşlarla istişare ile başlar. Aktörler arasında ortak yönetim ortaklığı yaratma ihtiyacını anladıklarında ve gördüklerinde, anlaşmanın müzakere edilmesine hazır olmak için organize edilmelidirler. Organizasyon boyutu, topluluktaki pasif bireyleri ortak bir vizyona sahip organize bir gruba dönüştürmek ve yüksek düzeyde katılım sağlamak için çok önemlidir.
• Ortak yönetim anlaşmasının ve ortak yönetişim kurumunun müzakere edilmesi: Bu, aktörler arasında güç paylaşımı uygulamasıdır. Müzakere yoluyla farklı aktörler endişelerini dile getirir ve doğal kaynakların nasıl yönetilmesi ve korunması gerektiğine dair fikirleriyle katkıda bulunurlar. Kimin karar alabileceği ve her bir aktörün sorumluluk ve hesap verme yükümlülüklerinin neler olduğu gibi yönetişim konuları da müzakere edilir.
• Yaparak öğrenme: Müzakere süreci doğrusal bir süreç değil, anlaşmanın uygulanması, ortak yönetişim kurumunun işleyişinin sürdürülmesi, sonuçlarının ve etkilerinin zaman içinde izlenmesi ve gözden geçirilmesine devam edilmesi ve anlaşmanın yenilenmesi için girdi sağlanması gibi sarmal döngülerden oluşur.

MAR-Liderlik programının tasarımında grup öğrenimi, akran geri bildirimi ve akranlar arası değişimler yer almaktadır. Bu, bursiyerlerin mevcut projeleri ve Mezoamerikan Resifi'nin korunmasına yönelik devam eden tutkuları için bir destek grubu geliştirmelerini sağlamak için sürekli sanal ağ oluşturma fırsatlarıyla birleştirilmiştir. MAR Liderlik, bursiyerlerin kendi aralarında ve uzmanlarla, topluluklarla, hükümetlerle ve akademik kurumlarla sınırlardan bağımsız olarak işbirliği yaptıkları birleşik, aktif bir MAR Liderlik ağı arayışındadır. Disiplinler, kuruluşlar ve coğrafi sınırlar arasında bağlantılar kurmak MAR-Liderlik misyonunun merkezinde yer almaktadır.

Yerel koruma liderlerinin kapasitesi güçlendirilerek, koruma projelerinin tasarımında ve uygulanmasında daha etkili olmaları ve böylece bu programa katılanlara yaşamları boyunca hizmet etmeleri sağlanmaktadır.

MAR Liderlik Programı grup ve bireysel eğitimler sunmaktadır:

Grup atölye çalışmaları sırasında bursiyerler proje tasarımı konusunda eğitilmekte ve liderlik yetenekleri geliştirilmektedir. Hedeflenen yetkinlikler arasında etkili iletişim stratejilerinin geliştirilmesi, topluluk önünde konuşma, müzakere ve çatışma çözümü, zaman yönetimi ve ekip yönetiminde liderlik yer almaktadır.

Bireysel eğitim için bursiyerler, kurslara veya teknik diploma programlarına, yoğun İngilizce veya İspanyolca derslerine, mentor ziyaretlerine, pilot projelere ziyaretlere, bursiyerin projesiyle ilgili konularla ilgilenen uluslararası kuruluşlarda stajlara ve ayrıca belirli bir bursiyerin projesinin fizibilitesini desteklemek için pazar araştırmaları ve veri üretimine katılmak için kullanılabilecek küçük bir bütçeye erişebilirler. Bu fonlar, hem program personeli hem de uluslararası uzmanlardan alınan girdilerle tasarlanan bir eğitim planına göre harcanmaktadır.

Sağlam politika çerçevelerinin varlığı, yerel ve ulusal mavi karbon girişimlerinin tasarlanmasını ve uygulanmasını kolaylaştırır. Bu politikalar, resmi hükümet desteğini ve kurumsal rollerin temelini teşvik eder ve diğer ulusal ve uluslararası politikalar, mekanizmalar ve stratejilerle (NDC'ler, REDD+ ve NAMA'lar gibi) bağlantılar sunar. Politika oluşturma süreci, aktörlerin haritasını çıkarmak, ilgilerini ölçmek ve desteklerini almak için ulusal makamlarla gayri resmi istişarelerle başlar. Bunlar ulusal ölçekli yapılar olduğundan, stratejik danışmanlık ve sürecin kolaylaştırılması önemlidir.

2015 yılında Bejuco snapper balıkçılığı, Marine Stewardship Council (MSC) tarafından tam bir değerlendirmeye tabi tutulmuştur. Ancak sertifikasyon süreci, ciddi ulusal yönetişim eksiklikleri nedeniyle 2016 yılında durdurulmuştur. Birçok küçük ölçekli balıkçılığın MSC'nin sıkı gerekliliklerini yerine getirmesinin zorluğu nedeniyle Fair Trade USA, MSC'nin çevresel standartlarını sağlam sosyal gerekliliklerle birleştiren bir Yakalama Balıkçılığı Programı geliştirmiştir. Sertifikasyon süreci aşamalıdır ve balıkçıların MSC'nin gerektirdiği gibi değerlendirme sırasında bir kerede değil, 6 yıllık bir süre boyunca standardın gerekliliklerine uymak için gerekli araçları geliştirmelerine olanak tanır. Adil Ticaret süreci, artizanal balıkçılık faaliyetlerinin çoğunun içinde bulunduğu sosyal ve yönetimsel gerçeklere daha iyi hitap etmektedir. Bu nedenle, balıkçılar ve değer zinciri paydaşları balıkçılığın ilk Adil Ticaret ön değerlendirmesine başlamıştır. Bu çözümün sertifikasyon yapı taşı yıllar içinde birçok değişikliğe uğramıştır, ancak proje üyeleri MSC sürecinin başlangıcından bu yana sertifikasyon girişiminin arkasındaki itici güç olan uygulanabilir, uzun vadeli sosyo-ekonomik iyileştirmelere doğru ilerlediklerini düşünmektedir.

Çevresel açıdan sürdürülebilir bir balıkçılığın geliştirilmesi ve yönetilmesi için hedef türler, yaygın hedef dışı av türleri, çevresel faktörler ve yönetim rejimleri için bir dizi performans göstergesinin oluşturulması gerekmektedir. Bejuco zanaatkar dip paraketa balıkçılığı için bunlara örnek olarak stok durumu, hedef dışı av ve ıskarta oranları, nesli tükenmekte olan ve/veya koruma altındaki türlerin avlanma oranları, deniz tabanı ve ilgili bentik organizmalar üzerindeki dişli etkileri, yerel yönetim planı ve ulusal balıkçılık yönetim kapasitesi verilebilir. 2007 yılından bu yana, Bejuco dip paraketa balıkçılığının av kompozisyonu, balıkçılara gece gezilerinde eşlik eden rıhtım kenarı gözlemcileri ve araştırmacılar tarafından sürekli olarak izlenmektedir. Bu bilgiler, balıkçıların ekolojik bilgilerinin toplanmasıyla birlikte, araştırmacıların bu göstergelerin çoğunu tanımlamasına olanak sağlamıştır. Ulusal hükümetle yakın işbirliği içinde, koruma alanı ve yönetim planı geliştirme girişimleri de şekillenmektedir.

Katılımcı kırsal değerlendirmeler, hem sosyo-ekonomik hem de çevresel durumun ve başlıca endişelerin bir resmini çizmeye yardımcı olur. Coğrafi değerlendirmeler ve coğrafi bilgi sistemlerinin kullanımı, proje alanının ve deniz seviyesinin yükselmesi ve tuzluluk gibi iklim değişikliği etkilerinden en çok etkilenen risk bölgelerinin belirlenmesine yardımcı olur.