إلى جانب احتوائها على تراث ثقافي محدد بموجب قانون حماية الممتلكات الثقافية الذي تطبقه وكالة الشؤون الثقافية، تحتوي الممتلكات على مناطق تتوافق مع حديقة يوشينو كومانو الوطنية التي تتولى إدارتها وزارة البيئة والمحافظات الثلاث المرتبطة بها: واكاياما ونارا ومي والسلطات المحلية التابعة لها. تم إنشاء مجلس المحافظات الثلاث لمواقع التراث العالمي المقدسة ومسارات الحج في سلسلة جبال كيي للتراث العالمي، وقد تم تأسيسه في البداية لمتابعة الترشيح لقائمة التراث العالمي، وبعد الإدراج، أصبح المجلس مسؤولاً عن تنسيق إجراءات الحفظ وتطوير خطة الإدارة. يعمل حكام المحافظات الثلاث كرؤساء ونواب للرئيس، بينما يعمل رؤساء البلديات ورؤساء التعليم في البلديات كأعضاء في المجلس. وتشارك وكالة الشؤون الثقافية بصفة مراقب. تتم حماية الممتلكات الثقافية بالتعاون مع إدارة حماية الممتلكات الثقافية والتنمية الإقليمية في كل محافظة والمسؤول عن البلدية. بالإضافة إلى ذلك، يتم تقديم المشورة للمجلس من قبل لجنة علمية تتألف من خبراء من عدة مجالات.
إن الاهتمام القوي للمحافظات الثلاث والحكومة بإدراج المناظر الطبيعية الثقافية لجبال كيي في قائمة التراث العالمي مكّن من إقامة شراكة بين المحافظات الثلاث والمؤسسات الحكومية المسؤولة عن الصون من أجل تطوير ومتابعة الترشيح.
ووفقًا لتوصيات لجنة التراث العالمي وقت الإدراج، وضعت المحافظات الثلاث خطة شاملة لإدارة الصون وأنشأت نظامًا تتولى فيه مجالس المحافظات الثلاث زمام المبادرة في الصون والإدارة. وكان لهذا النظام تأثير كبير على الطريقة التي رشحت بها العديد من المحافظات في اليابان مواقع أخرى لإدراجها على قائمة التراث العالمي وإدارة عملية حفظها مثل فوجيسان المكان المقدس ومصدر الإلهام الفني (جبل فوجي).