Tahap 2 menyatukan berbagai manajer lembaga, pemangku kepentingan lokal, dan peneliti untuk membahas serangkaian tujuan pengelolaan dan kebutuhan pemantauan terkait. Dalam proses kolaboratif ini, semua pemangku kepentingan menyumbangkan pengetahuan dan perspektif mereka tentang mandat hukum, kebijakan, dan faktor-faktor yang memengaruhi kunjungan dan pemanfaatan di dalam cagar alam tertentu. Manajer dan informan lokal berpartisipasi dalam serangkaian survei dan lokakarya yang berkembang dari kuesioner yang lebih luas menjadi kuesioner dengan pertanyaan yang lebih spesifik berdasarkan umpan balik sebelumnya. Panel ahli membahas tren pengunjung dan tantangan yang spesifik untuk memantau kunjungan di lokasi mereka. Hasil dari setiap survei dan lokakarya yang dilakukan secara berulang-ulang memberikan wawasan yang terperinci mengenai kondisi pengetahuan terkini mengenai kunjungan dan tingkat kepercayaan terhadap cara-cara yang digunakan untuk mendapatkan informasi tersebut.
Tahap 2 membutuhkan keterlibatan penuh antara manajer lokal dan peneliti. Ketika manajer melibatkan pemangku kepentingan lokal dan memberi tahu mereka tentang prosesnya, informasi yang diberikan kepada peneliti akan lebih komprehensif. Bagian dari proses ini bergantung pada pengembangan hubungan interpersonal antara peneliti dan pemangku kepentingan. Pengembangan hubungan kerja seperti itu melalui kontak lokakarya dan interaksi lainnya membantu membangun fondasi kepercayaan dan kerja sama untuk melanjutkan proses NMS-COUNT.
Pada Tahap 2, tim peneliti melibatkan para pengelola dan pemangku kepentingan untuk lebih memahami status kunjungan saat ini di cagar alam tersebut. Bekerja sama dengan Kantor NOAA NMS, para peneliti diberi akses untuk menghubungi 32 pengelola sumber daya lokal dan pemangku kepentingan yang memiliki pengetahuan institusional tentang situs tersebut. Hal ini memungkinkan tim peneliti untuk mengembangkan survei panel dan melibatkan para pemangku kepentingan lokal dalam forum panel. Seluruh pemangku kepentingan dikirimi kuesioner awal yang menanyakan pandangan mereka mengenai kunjungan ke cagar alam secara umum. Tiga pemangku kepentingan menanggapi kuesioner tersebut, memberikan umpan balik umum tentang kegiatan pengunjung, pola penggunaan temporal dan spasial, jalur menuju dan melalui Suaka Margasatwa, dan status penghitungan pengunjung saat ini. Berdasarkan umpan balik ini, kuesioner putaran kedua disempurnakan untuk digunakan pada lokakarya panel. Lokakarya tatap muka ini menampilkan diskusi rinci tentang tantangan yang teridentifikasi dalam pemantauan kunjungan di Gray's Reef NMS. Lokakarya ini juga memungkinkan diskusi terperinci tentang ketersediaan data yang ada untuk strategi pemantauan kunjungan awal dan upaya pemodelan.