تجمع المرحلة الثانية بين مختلف مديري الوكالات وأصحاب المصلحة المحليين والباحثين لمعالجة مجموعة من أهداف الإدارة واحتياجات الرصد المرتبطة بها. في هذه العملية التعاونية، يساهم جميع أصحاب المصلحة بمعارفهم ووجهات نظرهم حول التفويضات القانونية والسياسات والعوامل التي تؤثر على الزيارة والاستخدام داخل محمية معينة. يشارك المديرون والمخبرون المحليون في سلسلة من الاستبيانات وورش العمل التي تتقدم من استبيان أوسع نطاقاً إلى استبيان يتضمن أسئلة أكثر تحديداً بناءً على الملاحظات السابقة. تناقش لجنة الخبراء اتجاهات الزوار والتحديات الخاصة برصد الزيارات في مواقعهم. توفر نتائج كل استبيان وورشة عمل متكررة نظرة ثاقبة مفصلة عن الحالة الراهنة للمعرفة حول الزيارة ومستوى الثقة في طرق الحصول على هذه المعلومات.
تتطلب المرحلة الثانية مشاركة كاملة بين المدراء المحليين والباحثين. عندما يقوم المدراء بإشراك أصحاب المصلحة المحليين وإطلاعهم على العملية، تكون المعلومات المقدمة للباحثين أكثر شمولاً. يعتمد هذا الجزء من العملية على تطوير العلاقات الشخصية للباحثين وأصحاب المصلحة على حد سواء. ويساعد تطوير علاقات العمل هذه من خلال الاتصال في ورش العمل والتفاعلات الأخرى على إرساء أساس من الثقة والتعاون لكي تمضي عملية نظام الرصد الوطني-التعاون في مجال العلوم والتكنولوجيا قدماً.
في المرحلة الثانية، تواصل فريق البحث مع المديرين وأصحاب المصلحة لفهم حالة الزيارة الحالية في المحمية بشكل أفضل. ومن خلال العمل مع مكتب الإدارة الوطنية للمحيطات والغلاف الجوي NOAA، أتيح للباحثين إمكانية الاتصال بـ 32 من مديري الموارد المحلية وأصحاب المصلحة ذوي المعرفة المؤسسية بالموقع. وقد أتاح ذلك لفريق البحث تطوير استبيان وإشراك أصحاب المصلحة المحليين في منتدى للخبراء. أُرسل إلى جميع أصحاب المصلحة استبياناً أولياً يطلبون فيه آراءهم حول زيارة المحمية بشكل عام. أجاب ثلاثة من أصحاب المصلحة على الاستبيان، وقدموا ملاحظات عامة حول أنشطة الزوار، وأنماط الاستخدام الزمانية والمكانية، والمسارات المؤدية إلى المحمية وعبرها، وحالة الإحصاء الحالي للزوار. واستنادًا إلى هذه الملاحظات، تم تنقيح جولة ثانية من الاستبيانات لاستخدامها في ورشة العمل التي عقدتها اللجنة. تضمنت ورشة العمل الشخصية مناقشات مفصلة حول التحديات التي تم تحديدها لرصد الزيارة في محمية غرايز ريف المرجان. كما سمحت بمناقشة مفصلة لتوافر البيانات الحالية لاستراتيجيات رصد الزيارة الأولية وجهود النمذجة.