Fase 2 brengt verschillende agentschapsmanagers, lokale belanghebbenden en onderzoekers samen om een reeks beheerdoelstellingen en de bijbehorende monitoringbehoeften aan te pakken. In dit samenwerkingsproces brengen alle belanghebbenden hun kennis en perspectieven in op het gebied van wettelijke mandaten, beleid en factoren die van invloed zijn op bezoek en gebruik binnen een specifiek reservaat. Beheerders en lokale informanten nemen deel aan een reeks enquêtes en workshops die overgaan van een vragenlijst met een bredere basis naar een vragenlijst met specifiekere vragen op basis van eerdere feedback. Het deskundigenpanel bespreekt bezoekerstrends en uitdagingen die specifiek zijn voor het monitoren van het bezoek op hun locatie. De resultaten van elke iteratieve enquête en workshop geven een gedetailleerd inzicht in de huidige stand van kennis over bezoek en het niveau van vertrouwen in de manieren waarop deze informatie is verkregen.
Fase 2 vereist volledige betrokkenheid tussen de lokale beheerders en onderzoekers. Wanneer managers lokale belanghebbenden betrekken en hen informeren over het proces, is de informatie die aan onderzoekers wordt verstrekt uitgebreider. Dit deel van het proces is afhankelijk van de ontwikkeling van interpersoonlijke relaties voor zowel onderzoekers als belanghebbenden. De ontwikkeling van dergelijke werkrelaties via workshopcontacten en andere interacties helpt bij het leggen van een basis van vertrouwen en samenwerking waarop het NMS-COUNT proces kan voortbouwen.
In fase 2 schakelde het onderzoeksteam managers en belanghebbenden in om de huidige bezoekstatus van het heiligdom beter te begrijpen. In samenwerking met het NOAA Office of NMS kregen de onderzoekers toegang tot 32 lokale managers en belanghebbenden met institutionele kennis over de locatie. Dit stelde het onderzoeksteam in staat om een panelonderzoek te ontwikkelen en de lokale belanghebbenden te betrekken bij een panelforum. Alle belanghebbenden kregen een eerste vragenlijst toegestuurd waarin werd gevraagd naar hun mening over het bezoek aan het heiligdom in het algemeen. Drie belanghebbenden beantwoordden de vragenlijst en gaven algemene feedback over bezoekersactiviteiten, temporele en ruimtelijke gebruikspatronen, paden naar en door het heiligdom en de huidige telling van bezoekers. Op basis van deze feedback werd een tweede ronde vragenlijsten verfijnd voor gebruik tijdens de panelworkshop. Tijdens de persoonlijke workshop werden de geïdentificeerde uitdagingen voor het monitoren van het bezoek aan Gray's Reef NMS uitgebreid besproken. Er werd ook gedetailleerd gediscussieerd over de beschikbaarheid van bestaande gegevens voor de eerste strategieën voor bezoekmonitoring en modellering.