Pengumpulan data dan informasi secara kolaboratif digunakan untuk: mengidentifikasi dan memperoleh informasi sekunder; mendokumentasikan pengetahuan lokal mengenai sumber daya dan pemanfaatan ruang; mengembangkan skema klasifikasi habitat yang sesuai; melakukan survei lapangan pemetaan habitat laut; memvalidasi informasi yang dihasilkan; serta memastikan kapasitas teknologi dan preferensi informasi para pemangku kepentingan. Selain itu, penelitian partisipatif menunjukkan relevansi informasi yang diberikan oleh para pemangku kepentingan, memperkuat kapasitas, dan memberikan rasa memiliki terhadap informasi yang dihasilkan.

Keterlibatan pemangku kepentingan digunakan untuk menyempurnakan tujuan penelitian; memandu pengembangan metodologi; memperoleh/mendokumentasikan informasi, termasuk pengetahuan lokal; berbagi dan memvalidasi informasi yang dihasilkan; mengembangkan informasi yang relevan dan dapat diakses secara lokal; serta menilai penerapan sistem informasi geografis partisipatif. Untuk memungkinkan interaksi lintas-skala yang transparan, inklusif, dan adil, para pemangku kepentingan dilibatkan melalui mekanisme komunikasi satu dan dua arah (buletin, siaran pers, selebaran, laporan teknis, situs web, rangkuman, dan pertemuan validasi) dan melalui e-group khusus di internet.

Pembelajaran kelompok, umpan balik dari rekan sejawat, dan pertukaran antar rekan tertanam dalam desain program MAR-Leadership. Hal ini ditambah dengan peluang jaringan virtual yang sedang berlangsung untuk memungkinkan para fellow mengembangkan kelompok pendukung untuk proyek-proyek mereka saat ini dan hasrat mereka yang sedang berlangsung untuk konservasi Terumbu Karang Mesoamerika. Kepemimpinan MAR mencari jaringan Kepemimpinan MAR yang terkonsolidasi dan aktif di mana para rekan berkolaborasi di antara mereka sendiri dan dengan para ahli, komunitas, pemerintah, dan lembaga akademis, tanpa memandang batas. Menjalin hubungan lintas disiplin ilmu, organisasi, dan batas geografis merupakan inti dari misi MAR-Leadership.

Program MAR Leadership berupaya untuk menginkubasi ide-ide proyek baru menjadi proyek yang berpotensi untuk direplikasi (peningkatan skala) di sepanjang Ekoregion Terumbu Karang Mesoamerika. Proyek-proyek ini dikembangkan untuk menunjukkan dampak konservasi yang jelas dan terukur dalam jangka waktu 3 - 5 tahun. Setiap kelompok memiliki fokus tematik yang terkait dengan kebutuhan konservasi di wilayah tersebut. Sebagai contoh, pada tahun 2010, proyek-proyek para fellows berfokus pada pengembangan pesisir dan pariwisata; pada tahun 2011 pada perikanan berkelanjutan dan pembentukan Kawasan Konservasi Perairan (KKP); pada tahun 2012 pada pembentukan jaringan cagar alam laut multifungsi; pada tahun 2014 pada pengelolaan sampah terpadu dan pada tahun 2015 pada konservasi dan valuasi ekonomi dari jasa ekosistem bakau.

Kapasitas para pemimpin konservasi lokal diperkuat sehingga mereka menjadi lebih efektif dalam merancang dan mengimplementasikan proyek-proyek konservasi mereka dengan cara yang akan melayani rekan-rekan program ini sepanjang hidup mereka.

Program Kepemimpinan MAR menawarkan pelatihan kelompok dan individu:

Selama lokakarya kelompok, para peserta dilatih dalam desain proyek dan kemampuan kepemimpinan mereka diasah. Kompetensi yang ditargetkan termasuk pengembangan strategi komunikasi yang efektif, berbicara di depan umum, negosiasi dan resolusi konflik, manajemen waktu dan kepemimpinan dalam manajemen tim.

Untuk pelatihan individu, peserta pelatihan memiliki akses ke anggaran kecil yang dapat digunakan untuk berpartisipasi dalam kursus atau program diploma teknis, kelas bahasa Inggris atau Spanyol intensif, kunjungan ke mentor, kunjungan ke proyek percontohan, magang di organisasi internasional yang berhubungan dengan topik yang terkait dengan proyek peserta, serta pembuatan studi pasar dan pembuatan data untuk mendukung kelayakan proyek peserta. Dana ini digunakan sesuai dengan rencana pelatihan yang dirancang dengan masukan dari staf program dan para ahli internasional.