プログラム協定は、サイトの管理に関与する機関関係者の役割と責任を定義し、その概要を示している。この協定は、2018年8月3日に署名された実施議定書によって完成され、技術・管理スタッフで構成されるテクニカル・セクレタリー（2年間リグーリア州を率いる）が支援するユネスコ・サイト事務局の設立に関するプログラム協定の主要な要素を概説している。この実施計画では、ポルトヴェーネレ、チンクエテッレ、島々の世界遺産の技術的・管理的責任者として、ユネスコ遺産事務局を位置づけている。同事務所は、常設の技術・管理作業グループの支援と運営調整、地域活動の実施支援、管理計画の監視を行う中心的な役割を担い、世界遺産センター、イタリア省、国内ユネスコ事務局との中心的な役割を果たす。事務局長は、既存の運営委員会や作業部会（BB4）のすべての活動を調整する。

また、ユネスコ事務局は、ユネスコのガイドラインに基づき、地域の新たなニーズへの効果的な対応を強化するため、サイト内の利用者に提供されるサービスの改善に尽力している。