相次ぐ締約国会合において、関係政府が協定の実施に着手するにつれ、各国はペラゴス・サンクチュアリのための適切な管理機関を設立する意向がなく、その結果、この海域の鯨類に対する既存の脅威（海運、撹乱、騒音、化学汚染など）に対処するための管理行動が不十分であることが明らかになった。このため、フランスとイタリアのNGOや科学者コミュニティは、政府機関に圧力をかけ、メディアやその他の手段を通じて啓蒙活動を推進し、科学的成果の伝達や、保護区の保全効果を高めるための嘆願書の普及を促した。