In het district Bejuco zijn door onderzoekers, vissers en het Ministerie van Milieu twee multifunctionele MPA's ontwikkeld om het lokale snapperbestand beter te beheren. Deze gebieden staan het gebruik van ambachtelijke grondbeugen (het favoriete vistuig van de snappervissers in het gebied) en handlijnen toe, maar staan het gebruik van meer onselectieve methoden zoals garnalentrawlnetten niet toe. Costa Rica's MPA's aan de kust zijn begonnen als mariene uitbreidingen van eerder beschermde gebieden op het land, en de MPA's van Bejuco zijn niet anders. Oorspronkelijk waren ze bedoeld om zeeschildpadden te beschermen tegen garnalentrawlers, maar ze zijn geëvolueerd tot complexere instrumenten voor het beheer van ruimtelijke en temporele hulpbronnen aan de kust.

De MPA's in het gebied bieden een wettelijk kader dat de belangen van lokale vissers beschermt tegen de geïndustrialiseerde garnalentrawlvloot (garnalentrawlers vissen in het gebied op snappers omdat het economisch niet rendabel is om in Costa Rica op garnalen te vissen). Costa Rica ontwikkelt strategieën voor aanpassing aan de klimaatverandering die worden gefinancierd door het Aanpassingsfonds. Inherent hieraan is de verdere ontwikkeling van beschermde zeegebieden en er wordt gesproken over de haalbaarheid van uitbreiding van de twee bestaande gebieden.

Om een ecologisch duurzame visserij te ontwikkelen en te beheren, moet er een aantal prestatie-indicatoren worden vastgesteld voor de doelsoorten, veelvoorkomende bijvangstsoorten, milieufactoren en beheersregimes. Voorbeelden hiervan voor de ambachtelijke beugvisserij op Bejuco zijn de status van het bestand, bijvangst- en teruggooipercentages, vangstpercentages van bedreigde en/of beschermde soorten, de impact van het vistuig op de zeebodem en bijbehorende benthische organismen, het lokale beheerplan en de nationale visserijbeheercapaciteit. Sinds 2007 wordt de vangstsamenstelling van de beugvisserij in Bejuco continu gecontroleerd door waarnemers aan de kade en onderzoekers die de vissers vergezellen op hun nachtelijke tochten. Deze informatie, samen met de verzameling van ecologische kennis van de vissers, heeft de onderzoekers in staat gesteld om veel van deze indicatoren te identificeren. In nauwe samenwerking met de nationale overheid krijgen initiatieven voor de ontwikkeling van beschermde gebieden en beheerplannen ook vorm.

De regionale overheid werkt nu samen met de NGO's en filantropische organisaties aan de overgang van een door internationale NGO's geleid en door donoren gefinancierd initiatief naar een initiatief dat volledig door lokale instellingen wordt beheerd en dat duurzaam wordt gefinancierd. Als dit een succes wordt, zal het het eerste volledig duurzaam gefinancierde MPA-netwerk in Indonesië zijn en zal het als model dienen voor het hele land en de hele regio. De financiële duurzaamheid van het MPA-netwerk zal worden bereikt door gediversifieerde inkomstenbronnen, waaronder overheidstoewijzingen, bezoekersgelden en andere lokale financieringsmechanismen, lokale fondsenwerving en een speciaal trustfonds voor natuurbehoud. De BHS-coalitie heeft een alomvattend kostenmodel en bedrijfsplan ontwikkeld waarin de kosten, inkomsten en hiaten van het zeegebied worden geraamd voor het "steady state" beheersysteem dat naar verwachting in 2017 operationeel zal zijn. Meer dan 70% van de lokale kosten wordt al gedekt door lokale bronnen, met de grootste bijdrage van de overheid zelf. Hoewel deze lokale toezeggingen ongekend zijn, zijn er extra investeringen nodig om te zorgen voor een volledig duurzaam zeegebied. De coalitie werkt samen met de provinciale overheid aan de ontwikkeling van een speciaal trustfonds, het Blue Abadi Fund, om de kloof te dichten.