Как и во всех других проектах ISTAP, принимаются меры для обеспечения четкой цели WGWAP, своевременного получения высококачественных результатов и управления проектом в соответствии с политикой и процедурами МСОП. Структура управления проектом определяет роль и обязанности руководителя проекта и других сотрудников или подразделений МСОП. Председатель группы отвечает за руководство членами группы, которые представляют доклады по научным и техническим вопросам. Все члены группы, включая председателя, отчитываются перед МСОП и имеют свой круг полномочий.
Существует система регулярного мониторинга для проверки того, что группа работает в полном соответствии с принципами ISTAP, что она выполняет согласованные результаты в соответствии с кругом ведения и планом работы, а также что соблюдаются план взаимодействия с заинтересованными сторонами и коммуникационная стратегия. На основе плана работы руководитель проекта разрабатывает годовые бюджеты и, если это требуется по контракту, представляет их на подпись договаривающейся стороне.
ISTAP поддерживаются механизмом рассмотрения жалоб, который гарантирует, что полученные жалобы будут рассмотрены наиболее прозрачным, справедливым и своевременным образом.
Руководитель проекта сотрудничает с группой мониторинга и оценки МСОП для проверки целостности процесса работы группы и ее результатов, а также для оценки общего воздействия группы и потенциала для более широкого использования ее рекомендаций.
Создав систему мониторинга и оценки, МСОП удалось обеспечить подотчетность как группы, так и компании. Например, на презентации отчета WGWAP "Истории влияния" в 2016 году было сообщено, что из более чем 539 рекомендаций группы, адресованных "Сахалин Энерджи" и другим сторонам, 90 % были выполнены или заменены последующими рекомендациями.