Zoals bij alle ISTAP's zijn er maatregelen getroffen om ervoor te zorgen dat het WGWAP een duidelijk doel heeft, op tijd resultaten van hoge kwaliteit levert en wordt beheerd op een manier die in overeenstemming is met het beleid en de procedures van IUCN. Een projectmanagementstructuur definieert de rol en verantwoordelijkheden van de projectmanager en andere IUCN-medewerkers of -eenheden. De panelvoorzitter is verantwoordelijk voor het aansturen van de panelleden, die rapporteren over wetenschappelijke en technische kwesties. Alle panelleden, inclusief de voorzitter, rapporteren aan IUCN en hebben hun eigen taakomschrijving.
Er is een regelmatig monitoringsysteem om te controleren of het panel volledig in overeenstemming met de ISTAP-principes werkt, of het overeengekomen resultaten levert volgens de taakomschrijving en het werkplan, en of het plan voor betrokkenheid van belanghebbenden en de communicatiestrategie worden gevolgd. Op basis van het werkplan worden jaarlijkse begrotingen ontwikkeld door de projectmanager en, indien vereist onder het contract, ter goedkeuring voorgelegd aan de contractpartij.
ISTAP's worden ondersteund door een klachtenmechanisme om te garanderen dat ontvangen klachten op de meest transparante, eerlijke en tijdige manier worden behandeld.
De projectmanager werkt samen met het monitoring- en evaluatieteam van IUCN om de integriteit van het panelproces en de resultaten ervan te verifiëren, en om de algehele impact van het panel en het potentieel voor bredere acceptatie van de aanbevelingen te beoordelen.
Door een controle- en evaluatiesysteem op te zetten, heeft IUCN de verantwoordingsplicht van zowel het panel als het bedrijf kunnen waarborgen. Bij de lancering van het WGWAP Stories of Influence-rapport in 2016 werd bijvoorbeeld gemeld dat van de meer dan 539 aanbevelingen van het panel aan Sakhalin Energy en andere partijen, 90% was geïmplementeerd of door latere adviezen was vervangen.