Tüm ISTAP'larda olduğu gibi, WGWAP'ın da net bir amacı olmasını, yüksek kaliteli çıktıları zamanında sunmasını ve IUCN'nin politika ve prosedürleriyle tutarlı bir şekilde yönetilmesini sağlamak için önlemler alınmaktadır. Bir proje yönetim yapısı, proje yöneticisinin ve diğer IUCN personelinin veya birimlerinin rol ve sorumluluklarını tanımlar. Panel başkanı, bilimsel ve teknik konularda rapor veren panel üyelerini yönetmekten sorumludur. Başkan da dahil olmak üzere tüm panel üyeleri IUCN'ye rapor verir ve kendi görev tanımlarına sahiptir.
Panelin ISTAP ilkelerine tam olarak uygun şekilde çalıştığını, görev tanımı ve çalışma planına göre üzerinde anlaşmaya varılan çıktıları sağladığını ve paydaş katılım planı ile iletişim stratejisinin takip edildiğini doğrulamak için düzenli bir izleme sistemi vardır. Çalışma planına dayalı olarak, yıllık bütçeler proje yöneticisi tarafından geliştirilir ve sözleşme kapsamında gerekli olması halinde sözleşme tarafına onay için sunulur.
ISTAP'lar, alınan şikayetlerin en şeffaf, adil ve zamanında ele alınmasını garanti altına almak için bir şikayet mekanizması ile desteklenmektedir.
Proje yöneticisi, panel sürecinin ve çıktılarının bütünlüğünü doğrulamak ve panelin genel etkilerini ve tavsiyelerinin daha geniş çapta benimsenme potansiyelini değerlendirmek için IUCN'nin izleme ve değerlendirme ekibiyle birlikte çalışır.
IUCN, bir izleme ve değerlendirme sistemi kurarak hem panelin hem de şirketin hesap verebilirliğini güvence altına alabilmiştir. Örneğin, 2016 yılında WGWAP Etki Hikayeleri raporunun lansmanında, panelin Sakhalin Energy ve diğer taraflara verdiği 539'dan fazla tavsiyenin %90'ının uygulandığı veya sonraki tavsiyelerle değiştirildiği bildirilmiştir.