Ekosistem değişkenliğini ve değişimini yorumlayabilmek ve bunlara etkili bir şekilde yanıt verebilmek için yabani flora ve fauna da gösterge olarak kullanılmıştır. Çiftçiler yabani bitkilerin gelişimini ve yabani hayvanların gelişimini ve davranışlarını gözlemlemiş ve bu bilgileri arazi yönetimini planlamak ve ayarlamak için kullanmışlardır. Örneğin İsveç Roslagen'de huş ağacı yapraklarının büyüklüğü ne zaman ekim yapılacağına dair bir gösterge olabilir. Belirli bitki türlerinin varlığı toprak kalitesi hakkında bir gösterge vermektedir.
Doğal habitatın tarımsal ekosistemle birlikte var olduğu ve korunduğu bir ortamda bulunmak, doğal göstergelerin kullanılmasını sağlar.
Değişken koşullarda, ekim ve hasat zamanlaması kritik önem taşır. Doğal göstergeler, mahsulün başarısı veya en azından başarısızlığın azaltılması için önemli olan birçok bilgiyi yakalar.