Les appels publics du Fonds Iratapuru marquent une étape décisive dans la démocratisation de l'accès aux ressources, permettant aux communautés autour de la Réserve de développement durable du Rio Iratapuru (RDSI) et aux institutions de recherche de rivaliser de manière transparente et équitable. Depuis 2019, des appels annuels ont été lancés couvrant des lignes d'action axées sur le renforcement des communautés, l'amélioration des infrastructures productives, la promotion de l'éducation, la formation technique et le soutien à la recherche scientifique appliquée. Le processus comporte plusieurs étapes : large diffusion de l'appel, formation et accompagnement des communautés dans la préparation des propositions, analyse technique rigoureuse par le Comité de gestion, délibération collective et suivi ultérieur des projets approuvés. Ce dispositif permet non seulement de renforcer l'autonomie des communautés et de favoriser l'innovation locale, mais aussi d'étendre les impacts positifs dans la région, en contribuant au développement durable, au renforcement institutionnel et à la production de connaissances scientifiques visant à la conservation de la biodiversité et à la valorisation des moyens de subsistance traditionnels.

Avec la promulgation de la loi fédérale 13.123/2015, Natura a tenu des réunions avec le gouvernement de l'Amapá (SEMA/AP) et la communauté São Francisco do Iratapuru (représentée par COMARU et l'association Bio-Rio), ce qui a donné lieu à un addendum à l'accord qui a créé le Fonds Natura pour le développement durable des communautés traditionnelles, rebaptisé par la suite Fonds Iratapuru. Ces discussions ont mis en évidence la nécessité de soutenir la COMARU dans la gestion des ressources, qui seraient transférées du compte de Natura au sien, compte tenu des montants importants en jeu. Le Comité de gestion du Fonds Iratapuru a été créé, composé de cinq institutions votantes (COMARU, Bio-Rio, SEMA/AP, Natura et Fondation Jari) et de deux membres consultatifs (RURAP et SEBRAE/AP). Les accords définissent la composition du Fonds, la périodicité des transferts, les critères de candidature et l'obligation pour les projets financés d'aborder au moins l'une des 21 lignes d'action, l'accès se faisant par le biais d'appels publics.