I bandi pubblici del Fondo Iratapuru segnano un passo decisivo nella democratizzazione dell'accesso alle risorse, consentendo alle comunità intorno alla Riserva di sviluppo sostenibile del Rio Iratapuru (RDSI) e agli istituti di ricerca di competere in modo trasparente ed equo. Dal 2019 sono stati lanciati bandi annuali che riguardano linee d'azione incentrate sul rafforzamento delle comunità, il miglioramento delle infrastrutture produttive, la promozione dell'istruzione, la formazione tecnica e il sostegno alla ricerca scientifica applicata. Il processo prevede diverse fasi: ampia diffusione del bando, formazione e supporto alle comunità per la preparazione delle proposte, rigorosa analisi tecnica da parte del Comitato di gestione, delibera collettiva e successivo monitoraggio dei progetti approvati. Questo sistema non solo rafforza l'autonomia delle comunità e promuove l'innovazione locale, ma espande anche gli impatti positivi nella regione, contribuendo allo sviluppo sostenibile, al rafforzamento istituzionale e alla produzione di conoscenze scientifiche finalizzate alla conservazione della biodiversità e alla valorizzazione dei mezzi di sussistenza tradizionali.

Con la promulgazione della legge federale 13.123/2015, Natura ha tenuto incontri con il governo di Amapá (SEMA/AP) e la comunità di São Francisco do Iratapuru (rappresentata da COMARU e dall'Associazione Bio-Rio), che hanno portato a un addendum all'accordo che ha creato il Fondo Natura per lo sviluppo sostenibile delle comunità tradizionali, in seguito rinominato Fondo Iratapuru. Queste discussioni hanno evidenziato la necessità di supportare COMARU nella gestione delle risorse, che sarebbero state trasferite dal conto di Natura al proprio, visti gli importi significativi in gioco. È stato istituito il Comitato di gestione del Fondo Iratapuru, composto da cinque istituzioni con diritto di voto (COMARU, Bio-Rio, SEMA/AP, Natura e Jari Foundation) e due membri consultivi (RURAP e SEBRAE/AP). Gli accordi hanno definito la composizione del Fondo, la periodicità dei trasferimenti, i criteri di applicazione e il requisito che i progetti finanziati riguardino almeno una delle 21 linee d'azione, con accesso tramite bandi pubblici.