وكان الإعلان عن تحدي ميكرونيزيا في عام 2006 تتويجاً لعقود من العمل الذي قام به شعب ميكرونيزيا ومنظماتها لزيادة الوعي وتعزيز القدرة في جميع أنحاء هذه المنطقة على حفظ الموارد الطبيعية وإدارتها على نحو مستدام. وفي أوائل عام 2006، وقّع الرؤساء التنفيذيون في كل من الولايات القضائية على تحدي ميكرونيزيا وقدموه إلى المجتمع الدولي في حدث رفيع المستوى في المؤتمر الثامن للأطراف في اتفاقية الأمم المتحدة للتنوع البيولوجي في مارس 2006 في البرازيل. لقد خلقت عقود من العمل التمهيدي مقترنة بالتوقيت المناسب والدعاية في مؤتمر الأطراف الثامن لحظة تحدى فيها القادة السياسيون بعضهم البعض لتقديم هذا الالتزام الطموح. وكانت هذه الأهداف أكثر طموحًا بكثير حتى من أهداف آيتشي التي كانت ستتبعها في عام 2011 (17% برية و10% بحرية بحلول عام 2020). وحقيقة أن التزام القادة السياسيين على أعلى مستوى وفي جميع أنحاء المنطقة بهذا الهدف يحفز التنفيذ المحلي والتمويل الدولي للحفاظ على البيئة في ميكرونيزيا. وقد أصبح تحدي ميكرونيزيا الآن مؤسسة راسخة، وتم تعميمه في الأولويات الحكومية وبقي متداولاً في الإدارات في كل واحدة من الولايات القضائية الخمس المشاركة.

عند الاضطلاع بمهمة التخطيط أو تقسيم المناطق، نادراً ما يكون لدى المخطط إمكانية الوصول إلى جميع المعلومات أو المعرفة التي يرغب في الحصول عليها لمنطقة التخطيط بأكملها. وسواء أكان الأمر يتعلق ببيانات بيئية أكثر اتساقًا عبر منطقة التخطيط بأكملها أو فهمًا أكثر اكتمالاً لمجموعة كاملة من المعلومات الاجتماعية والاقتصادية، غالبًا ما يواجه المخطط الخيارات التالية

1. الانتظار حتى يحصل على المزيد من البيانات (بهدف تجميع معلومات "كاملة" عبر جميع مجموعات البيانات المطلوبة)؛ أو
2. العمل مع أفضل المعارف العلمية المتاحة وقبول أنه على الرغم من أنها ليست مثالية، إلا أنها كافية شريطة أن تكون أوجه القصور في البيانات مفهومة (من قبل المخططين وصانعي القرار) وتوضيحها بوضوح للجمهور وصانعي القرار. ويمكن أن يؤدي عدم كفاية المعرفة بالنظم الإيكولوجية البحرية إلى إعاقة وضع أهداف ذات مغزى أو نتائج مرغوبة عند التخطيط. تساءل ديفيد سوزوكي في عام 2002 كيف يمكننا التخطيط والإدارة بفعالية عندما "... حتى الآن كل ما حددناه بالفعل ... حوالي 10-20٪ من جميع الكائنات الحية"، و "... لدينا مثل هذا الجرد الضعيف للمكونات ومخطط غير مفيد تقريبًا لكيفية تفاعل جميع المكونات؟

يمكن وصف حدود المنطقة على أنها مسافة محددة من حافة معلم جغرافي (على سبيل المثال "500 متر من حافة الشعاب المرجانية"). ينتج عن هذا عادةً حدود منطقة غير منتظمة الشكل. قد يبدو تصوير الشعاب المرجانية أو مجموعة من الشعاب المرجانية بهذه الطريقة مناسبًا بيئيًا على الخريطة، لكن استخدام حافة هذه المعالم لرسم حدود المنطقة قد ثبت أنه من الصعب جدًا تفسيره على الماء. على سبيل المثال، العديد من أجزاء الشعاب المرجانية مجزأة أو مغمورة في بعض الأحيان، لذلك من الصعب على الماء تحديد حافة الشعاب المرجانية، ومن ثم استخدام ذلك لتقدير المسافة. علاوة على ذلك، ليس من السهل تقدير 500 متر (أو حتى 100 متر) على الماء. لذلك تم إدخال حدود المناطق القائمة على الإحداثيات، استنادًا إلى خطوط الطول/خطوط العرض والموضحة بالدرجات والدقائق العشرية في خطة تقسيم المناطق في غار حور العين لعام 2003. وتشمل هذه الحدود المعالم البيئية بالكامل (أي خارج حافة الشعاب المرجانية/الجزر بأكملها). يتم توجيه حدود المنطقة شمالًا وجنوبًا وشرقًا وغربًا لسهولة التنقل أو تتألف من خطوط مستقيمة بين إحداثيتين يسهل تحديدهما. وتبدو الخطوط المستقيمة أقل "ملاءمة من الناحية البيئية"، ولكن من الأسهل تحديدها وتطبيقها في المناطق البحرية، خاصة إذا تم استخدام الأجهزة الإلكترونية مثل النظام العالمي لتحديد المواقع أو الراسمة.

وأفضل مثال على الفرق بين التقسيم حسب الهدف بدلاً من التقسيم حسب النشاط هو المثال؛ فقد تشير منطقة "حظر الصيد بشباك الجر" بوضوح إلى حظر نشاط واحد (أي أن جميع عمليات الصيد بشباك الجر محظورة في تلك المنطقة)، ولكن قد لا يكون من الواضح ما هي الأنشطة الأخرى المسموح بها أو غير المسموح بها. يتيح الهدف من منطقة حماية الموائل مجموعة من الأنشطة التي لها تأثيرات (نسبياً) ضئيلة على الموائل القاعية داخل تلك المنطقة؛ على سبيل المثال، يُسمح بركوب القوارب والغوص والبحث المحدود التأثير، فضلاً عن السماح ببعض الأنشطة الاستخراجية مثل الصيد بالخيوط والشباك والصيد بالشباك والصيد بالرمح (أي بعض أنشطة الصيد وليس كلها). إلا أن هدف المنطقة وأحكام تقسيم المناطق ذات الصلة تحظر بوضوح الصيد بشباك الجر على القاع أو التجريف أو أي نشاط آخر يضر بالموائل الحساسة في تلك المنطقة. ويوجد في معظم المحيطات العديد من الأنشطة البحرية القائمة أو المحتملة التي تحتاج إلى إدارتها، ولكن العديد من هذه الأنشطة متكاملة ويمكن أن تحدث في نفس المنطقة؛ وإذا ما استُخدم تقسيم المناطق لمعالجة جميع الأنشطة القائمة (وتقسيم المحيطات هو بالتأكيد أداة هامة للقيام بذلك)، فمن الأفضل أن يكون التقسيم حسب الهدف بدلاً من كل نشاط على حدة.

في بعض أنحاء العالم، يعتمد تقسيم المناطق على السماح بأنشطة محددة أو حظرها في مناطق محددة. وتوجد في منطقة الخليج العربي مجموعة من المناطق، لكل منها أهداف مختلفة؛ وتسمح هذه المناطق بمجموعة من الأنشطة شريطة أن يتوافق كل نشاط مع هدف المنطقة ذات الصلة. تنطبق أحكام خطة تقسيم المناطق على جميع المستخدمين في منطقة الخليج العربي. وتحدد خطة تقسيم المناطق بالتفصيل قائمتين محددتين من أحكام "الاستخدام أو الدخول" لكل منطقة؛ وتساعد هذه الأحكام في تحديد أنواع الأنشطة المناسبة في تلك المنطقة المحددة. 1. تشير القائمة الأولى إلى الأنشطة المسموح بممارستها في تلك المنطقة ("كحق") والتي لا تتطلب تصريحًا؛ 2. القائمة الثانية تحدد الأنشطة التي يمكن أن تمارس في تلك المنطقة المعينة ولكن فقط بعد تقييم الطلب ومنح التصريح إذا كان الطلب مستوفيًا لجميع المتطلبات اللازمة. وتحدد اللوائح عملية التقييم ومعايير الحصول على تصريح؛ وتختلف هذه المعايير باختلاف النشاط المقترح. قد تنص بعض المناطق أيضًا على قيود على أنواع معدات الصيد التي توفر أيضًا مستويات مختلفة من الحماية. إذا لم يكن النشاط مدرجًا في أي من (1) أو (2) أعلاه، فإنه محظور في تلك المنطقة.