Afin de promouvoir la participation volontaire et de parvenir à un consensus entre les principaux secteurs concernés, les parties prenantes, notamment les autorités locales, les pêcheurs et les résidents locaux, sont identifiées à l'aide d'une cartographie préalable des acteurs. Les différents secteurs proposent ensuite leurs représentants qui s'engagent formellement dans le processus en signant un document. Une plateforme de dialogue multisectoriel est mise en place et les intérêts des parties prenantes sont discutés en utilisant une approche de facilitation collaborative et de résolution alternative des conflits. Cette plateforme aborde les questions de la délimitation géographique de la zone de gestion et du modèle de gouvernance avec les rôles et les responsabilités par secteur et par zone d'utilisation.

Une résolution administrative a été prise par les autorités locales chargées de la conservation afin de déterminer la faisabilité technique, sociale, juridique et financière de la mise en place de zones protégées dans les sites d'importance pour la conservation. La résolution prend en compte des informations provenant d'études scientifiques et souligne l'importance d'établir un processus participatif à travers la création d'un panel de dialogue multisectoriel. Parallèlement, les autorités locales ont créé un comité de suivi composé de représentants institutionnels de l'autorité nationale de gestion des zones protégées afin de légitimer le processus et de veiller à ce qu'il soit documenté et institutionnalisé.

Trois études scientifiques fournissent des informations techniques permettant d'identifier les zones qui devraient être incluses dans le système national de zones protégées. L'évaluation des écorégions marines en Méso-Amérique a constitué la première étape d'un programme de conservation de la biodiversité marine et côtière au niveau régional. Pour atteindre les objectifs fixés au niveau écorégional, les lacunes en matière de représentativité et d'intégrité de la biodiversité marine et côtière du Costa Rica ont été identifiées en comparant le système national d'aires marines protégées avec les sites d'importance pour la conservation identifiés lors de l'évaluation. Les sites nationaux d'importance pour la conservation ont été classés par ordre de priorité dans l'analyse des lacunes. Des évaluations techniques supplémentaires ont été réalisées pour préciser l'état de conservation au niveau des sites locaux. Ces informations scientifiques ont permis d'élaborer des considérations sur les priorités au niveau local et sur les utilisations réelles et potentielles, ainsi que sur les conflits d'utilisation.

Un accord de coopération définit les rôles et les responsabilités de chaque partenaire du partenariat public-privé et garantit l'application d'un plan de mise en œuvre et de suivi assorti d'un calendrier pour atteindre les objectifs de conservation.

Outre la définition des objectifs de conservation, le plan de mise en œuvre et de suivi détaille également les objectifs stratégiques et les activités à mettre en œuvre au cours d'une période donnée pour atteindre ces objectifs. En outre, le plan identifie les risques et les difficultés potentiels et fournit des indicateurs pour le suivi et l'évaluation.

L'administrateur du fonds, l'ONG FUNDECODES, et d'autres courtiers font la promotion des CCU auprès des investisseurs, qui les achètent pour une durée d'au moins dix ans. Les revenus des CCU sont répartis entre les différentes zones de la zone du projet : 40 % pour les activités de conservation dans la zone centrale, 40 % pour les activités de production durable dans la zone tampon commerciale et 20 % pour les propriétaires des terres génératrices de crédit.

Les stratégies spécifiques à chaque bassin versant sont définies dans un plan d'action pour la gestion intégrée des bassins versants, qui est adaptatif et évolue à partir d'une base scientifique. Le plan d'action est élaboré conjointement par les parties prenantes locales et permettra aux bassins versants prioritaires de retrouver leur fonctionnalité et de mieux fournir des services écosystémiques, tels que de l'eau propre pour soutenir des mangroves saines qui offrent des avantages en matière d'adaptation au climat.

La solution est financée par une combinaison de fonds d'amortissement et de fonds de dotation du Fonds pour l'environnement mondial (FEM), ainsi que par des fonds de contrepartie provenant d'autres donateurs et de fonds publics. Les fonds de dotation du FEM fournissent un financement à long terme pour répondre aux besoins de conservation dans les bassins versants côtiers et sont partiellement dédiés au fonctionnement de base des zones protégées. Les fonds d'amortissement publics provenant des programmes de la CONAFOR et des mécanismes de paiement pour les services écosystémiques augmentent la connectivité des bassins versants. Des subventions financent des projets de gestion durable des forêts et d'agroécologie. Le plan d'action intégré pour les bassins versants contribuera à aligner ces investissements publics et privés au niveau du paysage.